More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2622 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
470 aa  970    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  49.68 
 
 
500 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.38 
 
 
473 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.78 
 
 
479 aa  424  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  45.82 
 
 
514 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  45.87 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  44.11 
 
 
493 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.04 
 
 
1091 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  41.14 
 
 
497 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  42.43 
 
 
490 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
489 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  40.88 
 
 
537 aa  354  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
474 aa  352  8e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
502 aa  347  3e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  39.49 
 
 
493 aa  335  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  38.43 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  38.09 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
502 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  39.45 
 
 
495 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  38.51 
 
 
491 aa  316  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  40.35 
 
 
516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  34.5 
 
 
498 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  36.48 
 
 
482 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 
481 aa  289  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
491 aa  287  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  35.29 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
474 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  36.82 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.18 
 
 
464 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  33.76 
 
 
490 aa  263  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.98 
 
 
605 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.86 
 
 
553 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.87 
 
 
531 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.86 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 
568 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 
467 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.59 
 
 
501 aa  227  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.98 
 
 
526 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.77 
 
 
548 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31 
 
 
534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.39 
 
 
550 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.72 
 
 
518 aa  223  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  31.6 
 
 
469 aa  222  9e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  32.22 
 
 
557 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.76 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.84 
 
 
574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.64 
 
 
568 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  34.27 
 
 
483 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.08 
 
 
562 aa  216  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.53 
 
 
573 aa  216  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  33.13 
 
 
551 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  33.12 
 
 
484 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.74 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.06 
 
 
530 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.71 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  29.56 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.06 
 
 
566 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 
566 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  34.49 
 
 
553 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
551 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 
558 aa  212  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
571 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 
566 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.45 
 
 
566 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.61 
 
 
458 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
579 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 
566 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
551 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  29.82 
 
 
540 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
553 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.67 
 
 
590 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
551 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  33.54 
 
 
551 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.09 
 
 
593 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.96 
 
 
568 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.47 
 
 
509 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 
553 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.08 
 
 
481 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  31.01 
 
 
543 aa  207  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 
566 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.56 
 
 
497 aa  206  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
551 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 
566 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.94 
 
 
571 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  29.68 
 
 
466 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  29.68 
 
 
466 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 
566 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  32.07 
 
 
512 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
566 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.11 
 
 
564 aa  202  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.2 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  28.54 
 
 
582 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  28.35 
 
 
568 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  28.03 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.17 
 
 
517 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.29 
 
 
569 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  32.63 
 
 
451 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.13 
 
 
512 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>