More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0282 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
489 aa  1001    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  49.17 
 
 
493 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  45.78 
 
 
500 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  43.87 
 
 
497 aa  425  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  44.74 
 
 
490 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.51 
 
 
479 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.67 
 
 
1091 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  40.33 
 
 
510 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  41.98 
 
 
537 aa  381  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.04 
 
 
473 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
470 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  42 
 
 
516 aa  372  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  40.4 
 
 
493 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  39.79 
 
 
471 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  38.89 
 
 
495 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 
502 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  40.77 
 
 
463 aa  352  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
502 aa  345  7e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  37.39 
 
 
514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
491 aa  339  5.9999999999999996e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
474 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 
474 aa  329  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  39.83 
 
 
491 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  36.9 
 
 
464 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  39.11 
 
 
490 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  38.05 
 
 
494 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  36.65 
 
 
498 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  36.42 
 
 
482 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 
481 aa  299  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.47 
 
 
531 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  34.55 
 
 
605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.73 
 
 
553 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  36.01 
 
 
490 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.95 
 
 
481 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.13 
 
 
534 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.46 
 
 
550 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
518 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  30.61 
 
 
568 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.92 
 
 
574 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.51 
 
 
497 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.8 
 
 
501 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.02 
 
 
501 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.62 
 
 
530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.16 
 
 
541 aa  243  6e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  33.81 
 
 
469 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
568 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 
509 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  32.39 
 
 
557 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.99 
 
 
564 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.02 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  30.56 
 
 
540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  32.64 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.29 
 
 
512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.32 
 
 
548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.7 
 
 
526 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  28 
 
 
543 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.46 
 
 
535 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.01 
 
 
581 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  29.78 
 
 
581 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.07 
 
 
571 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.99 
 
 
547 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  30.39 
 
 
528 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.07 
 
 
647 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  32.98 
 
 
483 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.49 
 
 
593 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.21 
 
 
568 aa  224  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  29.2 
 
 
571 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  31.95 
 
 
764 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.34 
 
 
574 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.47 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.01 
 
 
593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.73 
 
 
573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
551 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.1 
 
 
547 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
579 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.74 
 
 
510 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 
770 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
551 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 
551 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.18 
 
 
641 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 
551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.98 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
551 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
553 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.26 
 
 
585 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
551 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.13 
 
 
562 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.25 
 
 
568 aa  212  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.98 
 
 
576 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.84 
 
 
810 aa  211  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.57 
 
 
558 aa  210  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 
568 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
566 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 
569 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.77 
 
 
566 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.28 
 
 
553 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.35 
 
 
568 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
553 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>