More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0379 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  100 
 
 
464 aa  937    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 
489 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  37.98 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.53 
 
 
479 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
502 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  34.13 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  38.7 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  38.13 
 
 
491 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  38.39 
 
 
510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  36.7 
 
 
500 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.05 
 
 
473 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
474 aa  275  8e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  38.36 
 
 
482 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 
470 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  35.5 
 
 
531 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
474 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
491 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.38 
 
 
497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.28 
 
 
605 aa  267  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  37 
 
 
495 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  37.92 
 
 
516 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  35.18 
 
 
537 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  35.99 
 
 
481 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  36.33 
 
 
498 aa  262  8e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
491 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  34.57 
 
 
471 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.4 
 
 
541 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
481 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  35.76 
 
 
514 aa  256  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.41 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.69 
 
 
1091 aa  254  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  29.23 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  36.74 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  32.05 
 
 
566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.79 
 
 
568 aa  244  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  36.98 
 
 
490 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  33.14 
 
 
571 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
518 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  31.8 
 
 
593 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  36.93 
 
 
494 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.48 
 
 
510 aa  237  3e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.79 
 
 
581 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.8 
 
 
568 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.31 
 
 
534 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 
509 aa  237  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.15 
 
 
557 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
566 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  32.49 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 
566 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  34.09 
 
 
501 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.23 
 
 
526 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.23 
 
 
548 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.08 
 
 
566 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
568 aa  231  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.26 
 
 
495 aa  230  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.04 
 
 
530 aa  230  5e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.96 
 
 
593 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.36 
 
 
497 aa  229  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 
566 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.84 
 
 
579 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
566 aa  228  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.08 
 
 
569 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 
566 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  28.21 
 
 
574 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  32.77 
 
 
469 aa  226  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 
566 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
566 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.69 
 
 
564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  30.16 
 
 
581 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.75 
 
 
528 aa  219  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.5 
 
 
568 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  30.75 
 
 
576 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 
568 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  31.18 
 
 
571 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.29 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  33.33 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  30.91 
 
 
568 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.14 
 
 
641 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.07 
 
 
547 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  31.96 
 
 
764 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  31.3 
 
 
501 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  31.97 
 
 
449 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.47 
 
 
562 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.68 
 
 
550 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.69 
 
 
569 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.69 
 
 
569 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.31 
 
 
512 aa  204  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.63 
 
 
541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  32.03 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
482 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.81 
 
 
574 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 
551 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.92 
 
 
647 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  31.59 
 
 
540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 
551 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  30.93 
 
 
484 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.79 
 
 
573 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.94 
 
 
558 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>