More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3111 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  64.94 
 
 
535 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  100 
 
 
540 aa  1060    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  58.44 
 
 
543 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  54.71 
 
 
547 aa  533  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.94 
 
 
547 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  55.87 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.61 
 
 
580 aa  498  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  44.3 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  43.52 
 
 
534 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  38.86 
 
 
557 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  38.55 
 
 
553 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  37.16 
 
 
581 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  35.78 
 
 
564 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  38.3 
 
 
581 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  34.28 
 
 
587 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.65 
 
 
605 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 
630 aa  279  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 
551 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  32.77 
 
 
576 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  33.75 
 
 
553 aa  259  7e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.7 
 
 
568 aa  259  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.57 
 
 
574 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
568 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
551 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 
551 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 
579 aa  253  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
553 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.29 
 
 
551 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.6 
 
 
569 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.6 
 
 
569 aa  250  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.82 
 
 
571 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  36.8 
 
 
509 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 
551 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.56 
 
 
551 aa  248  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 
627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  32.62 
 
 
581 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.43 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.75 
 
 
553 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  34.75 
 
 
582 aa  243  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.39 
 
 
593 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.78 
 
 
553 aa  243  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.2 
 
 
553 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34.13 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.59 
 
 
541 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
489 aa  239  9e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.19 
 
 
548 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.87 
 
 
497 aa  236  8e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.58 
 
 
569 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.95 
 
 
501 aa  233  9e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.46 
 
 
568 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.31 
 
 
497 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 
491 aa  232  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
566 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
566 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.3 
 
 
568 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  32.8 
 
 
478 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  33.15 
 
 
574 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  29.69 
 
 
549 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
571 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 
566 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.49 
 
 
493 aa  228  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.76 
 
 
566 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.06 
 
 
570 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.06 
 
 
570 aa  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 
566 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.89 
 
 
568 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.44 
 
 
566 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.82 
 
 
512 aa  224  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.16 
 
 
501 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  27.15 
 
 
641 aa  220  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.61 
 
 
530 aa  219  7e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  30.09 
 
 
585 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 
566 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.59 
 
 
550 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.57 
 
 
641 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 
502 aa  219  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 
566 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.43 
 
 
573 aa  219  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.15 
 
 
526 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  29.25 
 
 
474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.57 
 
 
481 aa  217  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.63 
 
 
562 aa  215  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.69 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 
470 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 
558 aa  211  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.5 
 
 
490 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.07 
 
 
486 aa  210  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.33 
 
 
558 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 
502 aa  210  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  35.07 
 
 
966 aa  210  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.22 
 
 
479 aa  208  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.12 
 
 
540 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.06 
 
 
541 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.27 
 
 
495 aa  204  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.46 
 
 
590 aa  203  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  31.92 
 
 
469 aa  203  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.19 
 
 
464 aa  202  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>