More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0900 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 474 aa  973    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 		 502 aa  350  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  40.21 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.63 
 
 		 497 aa  332  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 489 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.05 
 
 		 479 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  36.46 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  39.83 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  33.97 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  38.16 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  35.84 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  34.35 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.55 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  34.62 
 
 		 537 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  35.27 
 
 		 491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  34.53 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.09 
 
 		 1091 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 491 aa  282  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.4 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34 
 
 		 464 aa  275  9e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  33.63 
 
 		 463 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  35.12 
 
 		 490 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  34.16 
 
 		 516 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  30.23 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.21 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  33.04 
 
 		 490 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  32.89 
 
 		 494 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.3 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.27 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 530 aa  234  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.63 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.45 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  29.55 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.42 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  28.11 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  27.71 
 
 		 568 aa  226  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.48 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.95 
 
 		 557 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.51 
 
 		 535 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  29.39 
 
 		 543 aa  220  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.44 
 
 		 553 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  27.54 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.28 
 
 		 478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.92 
 
 		 566 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.5 
 
 		 573 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.33 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 568 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  27.92 
 
 		 540 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.74 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.41 
 
 		 569 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.41 
 
 		 569 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  28.63 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.29 
 
 		 581 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  28.01 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.13 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  26.27 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.48 
 
 		 469 aa  202  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.36 
 
 		 647 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.81 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  28.54 
 
 		 574 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.8 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 566 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 		 566 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  26.43 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.22 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  25.7 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  25.68 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 		 566 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.21 
 
 		 581 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.29 
 
 		 590 aa  196  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.04 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  27.96 
 
 		 568 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 551 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.69 
 
 		 550 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.5 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  27.57 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.44 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.6 
 
 		 450 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 566 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.55 
 
 		 579 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  26.72 
 
 		 547 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.37 
 
 		 553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  26.54 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.9 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.27 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.27 
 
 		 570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.29 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  27.29 
 
 		 764 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>