More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001242 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  69.22 
 
 		 569 aa  812    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  89.96 
 
 		 593 aa  1059    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 579 aa  1186    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  52.58 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  52.22 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  49.73 
 
 		 558 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.02 
 
 		 573 aa  548  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  49.08 
 
 		 568 aa  532  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.6 
 
 		 590 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  47.27 
 
 		 570 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  47.27 
 
 		 570 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.2 
 
 		 562 aa  507  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  42.73 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  43.45 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  43.74 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 566 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 		 566 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 566 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.79 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.86 
 
 		 558 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  35.23 
 
 		 548 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.25 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  33.21 
 
 		 571 aa  326  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  35.33 
 
 		 605 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 568 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  31.93 
 
 		 593 aa  320  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.14 
 
 		 568 aa  319  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  33.15 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  34.7 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.99 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  33.58 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.77 
 
 		 541 aa  280  5e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.87 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  28.36 
 
 		 641 aa  273  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.34 
 
 		 510 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  32.42 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  32.42 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.69 
 
 		 627 aa  270  8e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  31.66 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.68 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.32 
 
 		 550 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.9 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.63 
 
 		 526 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.45 
 
 		 564 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 530 aa  249  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.44 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.88 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.31 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  29.73 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 518 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.36 
 
 		 509 aa  246  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.29 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 540 aa  240  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.51 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  29.54 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  32.1 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.51 
 
 		 647 aa  231  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.14 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  30.34 
 
 		 547 aa  231  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.73 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  28.25 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  29.84 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.43 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.14 
 
 		 587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.57 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  31.4 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  30.29 
 
 		 491 aa  220  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 489 aa  220  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.67 
 
 		 641 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.19 
 
 		 512 aa  216  8e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  30.08 
 
 		 535 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  29.29 
 
 		 500 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 770 aa  208  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.91 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.91 
 
 		 479 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  28.12 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  28.34 
 
 		 581 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.24 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  27.95 
 
 		 895 aa  206  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.99 
 
 		 810 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  31.02 
 
 		 628 aa  204  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  30.69 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.98 
 
 		 539 aa  203  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  30.56 
 
 		 510 aa  203  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  27.88 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  30.36 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  27.88 
 
 		 467 aa  200  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>