More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4400 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  100 
 
 		 543 aa  1049    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  66.79 
 
 		 535 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  62.52 
 
 		 530 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  57.32 
 
 		 580 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  56.53 
 
 		 547 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.9 
 
 		 547 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  44.8 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  46.28 
 
 		 534 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  40.18 
 
 		 557 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 518 aa  322  9.000000000000001e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  38.02 
 
 		 553 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 581 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  36.84 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  34.07 
 
 		 564 aa  293  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  34.32 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.46 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 		 627 aa  260  4e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 551 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 551 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  32.96 
 
 		 553 aa  256  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  32.96 
 
 		 551 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 		 553 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  36.3 
 
 		 582 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.75 
 
 		 553 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  36.91 
 
 		 568 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  35.14 
 
 		 553 aa  249  7e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  37.29 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  33.88 
 
 		 493 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  33.46 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 568 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  36.83 
 
 		 571 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  34.06 
 
 		 497 aa  246  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  37 
 
 		 510 aa  246  6e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  32.26 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.39 
 
 		 568 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.35 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.59 
 
 		 571 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  35.85 
 
 		 574 aa  240  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 566 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  35.87 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 566 aa  239  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 566 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 		 489 aa  238  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.49 
 
 		 566 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  35.32 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.62 
 
 		 566 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.8 
 
 		 497 aa  236  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  29.22 
 
 		 641 aa  233  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.35 
 
 		 548 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.89 
 
 		 566 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.55 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.09 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.49 
 
 		 562 aa  230  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.1 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.86 
 
 		 550 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.23 
 
 		 569 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.23 
 
 		 569 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  35.4 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  37.99 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  30.28 
 
 		 502 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.62 
 
 		 490 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 		 630 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  32.32 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  31.3 
 
 		 593 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  34.25 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.7 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.68 
 
 		 537 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.2 
 
 		 647 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.28 
 
 		 579 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  31.01 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.88 
 
 		 540 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.86 
 
 		 479 aa  213  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.89 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.17 
 
 		 569 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.51 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  32.25 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.43 
 
 		 568 aa  211  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.25 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.61 
 
 		 590 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.87 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  35.84 
 
 		 966 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 474 aa  206  7e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  32.65 
 
 		 498 aa  204  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.62 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  33.14 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>