More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0824 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 770 aa  1575    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  44.34 
 
 		 810 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  36.73 
 
 		 628 aa  326  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  32.82 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.3 
 
 		 568 aa  271  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.24 
 
 		 553 aa  270  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.1 
 
 		 571 aa  260  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.54 
 
 		 509 aa  247  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.33 
 
 		 501 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.81 
 
 		 605 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.98 
 
 		 497 aa  241  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  33.73 
 
 		 568 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.29 
 
 		 568 aa  238  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  25.12 
 
 		 895 aa  232  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.31 
 
 		 568 aa  232  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.61 
 
 		 593 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.44 
 
 		 458 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  30.96 
 
 		 477 aa  230  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.45 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.75 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.35 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 482 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  31.29 
 
 		 576 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.14 
 
 		 551 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  32.18 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.71 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.99 
 
 		 569 aa  220  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.36 
 
 		 581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.49 
 
 		 581 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  30.58 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.52 
 
 		 647 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  30.58 
 
 		 570 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.1 
 
 		 510 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  29.42 
 
 		 582 aa  214  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.88 
 
 		 501 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.33 
 
 		 517 aa  212  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.52 
 
 		 531 aa  212  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  30.8 
 
 		 512 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.52 
 
 		 557 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.19 
 
 		 534 aa  211  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 		 551 aa  210  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 551 aa  210  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 558 aa  209  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 553 aa  208  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 		 579 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.63 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 551 aa  207  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.29 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  29.56 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 627 aa  206  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 553 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.68 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.17 
 
 		 573 aa  206  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.62 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.5 
 
 		 569 aa  205  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.3 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.96 
 
 		 553 aa  204  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.52 
 
 		 562 aa  203  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  24.65 
 
 		 764 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.56 
 
 		 593 aa  202  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 		 566 aa  201  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  29.94 
 
 		 488 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  29.94 
 
 		 488 aa  201  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.35 
 
 		 490 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  28.85 
 
 		 571 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.51 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.49 
 
 		 493 aa  197  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.12 
 
 		 456 aa  196  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 		 566 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.21 
 
 		 566 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.21 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  29.94 
 
 		 488 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.21 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 		 549 aa  194  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.46 
 
 		 547 aa  192  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  29.72 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.72 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.8 
 
 		 537 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 		 566 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.56 
 
 		 483 aa  190  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  28.79 
 
 		 526 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  29.83 
 
 		 528 aa  190  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.6 
 
 		 469 aa  189  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  29.32 
 
 		 510 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  29.83 
 
 		 451 aa  185  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.16 
 
 		 558 aa  185  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.51 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  30.35 
 
 		 497 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  32.1 
 
 		 475 aa  184  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  29.52 
 
 		 530 aa  183  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>