More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0255 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 474 aa  976    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  42.31 
 
 		 495 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  44.37 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  43.51 
 
 		 498 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 		 470 aa  352  8e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  40 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  40.76 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  41.51 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  38.66 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.22 
 
 		 1091 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 		 502 aa  313  4.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  39.37 
 
 		 514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.42 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 491 aa  303  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  36.03 
 
 		 493 aa  302  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  36.33 
 
 		 497 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  36.52 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 474 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  36.6 
 
 		 537 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  36.38 
 
 		 516 aa  293  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.74 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  39.44 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  35.82 
 
 		 482 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  35.05 
 
 		 605 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  34.04 
 
 		 490 aa  269  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  33.68 
 
 		 464 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  34.93 
 
 		 494 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  35.43 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  32.7 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.04 
 
 		 553 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.78 
 
 		 557 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.59 
 
 		 497 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.49 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.58 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.65 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.23 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.03 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.45 
 
 		 564 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.56 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  29.02 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.8 
 
 		 512 aa  219  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.9 
 
 		 593 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.26 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.24 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.14 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.32 
 
 		 568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.85 
 
 		 574 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  27.59 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 551 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.29 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.22 
 
 		 571 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  29.84 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  32.56 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  28.95 
 
 		 543 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.69 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  29.23 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.23 
 
 		 568 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  29.96 
 
 		 547 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  28.74 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 551 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 		 551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  28.24 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.33 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.81 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 		 558 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.84 
 
 		 764 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 		 566 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 568 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.8 
 
 		 541 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  26.9 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  31.73 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 		 566 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.12 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.97 
 
 		 568 aa  192  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  28.66 
 
 		 540 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  27.45 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.92 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 627 aa  190  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  26.34 
 
 		 566 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  27.99 
 
 		 576 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  28.3 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.31 
 
 		 568 aa  187  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.15 
 
 		 570 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.15 
 
 		 570 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.78 
 
 		 573 aa  187  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.49 
 
 		 593 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>