More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2676 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  100 
 
 
587 aa  1194    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  55.11 
 
 
553 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  49.91 
 
 
581 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  42.18 
 
 
564 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  42.37 
 
 
557 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  38.18 
 
 
531 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  37.57 
 
 
534 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
581 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
518 aa  348  2e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  38.45 
 
 
547 aa  347  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.54 
 
 
605 aa  340  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  36.23 
 
 
553 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  35.73 
 
 
576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
553 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
551 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
551 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
551 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
551 aa  323  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 
551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
553 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
553 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  32.76 
 
 
574 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  36.72 
 
 
571 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  33.73 
 
 
568 aa  309  8e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 
630 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.75 
 
 
568 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  34.72 
 
 
535 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  34.28 
 
 
540 aa  299  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  33.9 
 
 
569 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  33.73 
 
 
569 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  34.94 
 
 
581 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 
549 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.94 
 
 
541 aa  286  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
571 aa  286  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  31.42 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.69 
 
 
530 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.78 
 
 
547 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.17 
 
 
641 aa  278  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  33.68 
 
 
543 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  33.82 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.34 
 
 
510 aa  272  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  33.76 
 
 
500 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  32.47 
 
 
585 aa  266  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.24 
 
 
580 aa  264  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 
569 aa  263  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.58 
 
 
568 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
558 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  33.87 
 
 
512 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.27 
 
 
501 aa  257  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  32.19 
 
 
530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.76 
 
 
568 aa  252  1e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.73 
 
 
582 aa  252  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 
566 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.17 
 
 
566 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  32.02 
 
 
570 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.77 
 
 
497 aa  251  4e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  32.02 
 
 
570 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.89 
 
 
566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.75 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.21 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.12 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 
502 aa  243  5e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 
566 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.76 
 
 
568 aa  243  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.76 
 
 
562 aa  243  9e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.71 
 
 
566 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.71 
 
 
566 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 
566 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.47 
 
 
526 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.07 
 
 
566 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.71 
 
 
566 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.97 
 
 
573 aa  242  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 
579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.88 
 
 
540 aa  239  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.83 
 
 
493 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 
566 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.44 
 
 
810 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
491 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.39 
 
 
471 aa  233  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.04 
 
 
590 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.15 
 
 
641 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 
491 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.84 
 
 
550 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  30.87 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
770 aa  221  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  29.32 
 
 
494 aa  221  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.22 
 
 
528 aa  220  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  30.53 
 
 
497 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.03 
 
 
464 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.48 
 
 
548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
474 aa  212  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30 
 
 
558 aa  212  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.24 
 
 
517 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  29.98 
 
 
495 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.47 
 
 
1091 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  29.38 
 
 
628 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.09 
 
 
541 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.97 
 
 
463 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>