More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
580 aa  1120    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  54.53 
 
 
535 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  49.91 
 
 
540 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  51.4 
 
 
530 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  52.76 
 
 
547 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  46.9 
 
 
547 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  40.11 
 
 
531 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  66.16 
 
 
543 aa  340  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  37.97 
 
 
557 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  35.13 
 
 
553 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  33.04 
 
 
564 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  33.45 
 
 
581 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
581 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.47 
 
 
518 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  52.87 
 
 
534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  32.24 
 
 
587 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
630 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.16 
 
 
605 aa  252  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 
627 aa  250  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.8 
 
 
530 aa  240  5e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.82 
 
 
541 aa  240  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
571 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.23 
 
 
641 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 
551 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.47 
 
 
568 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  31.2 
 
 
571 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 
551 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  35.17 
 
 
582 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  33.52 
 
 
498 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
551 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  34.36 
 
 
568 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  32.68 
 
 
553 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 
553 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 
551 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.42 
 
 
551 aa  223  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 
502 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.14 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 
553 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  27.19 
 
 
553 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 
553 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 
549 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.64 
 
 
510 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.32 
 
 
593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  33.45 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.64 
 
 
512 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.04 
 
 
540 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27 
 
 
574 aa  212  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.44 
 
 
490 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.39 
 
 
579 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  32.17 
 
 
471 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.22 
 
 
566 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.69 
 
 
593 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.57 
 
 
590 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.16 
 
 
566 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.32 
 
 
569 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.4 
 
 
569 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
566 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.11 
 
 
493 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.27 
 
 
566 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  30.99 
 
 
585 aa  202  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.32 
 
 
576 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.02 
 
 
566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 
566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  25.68 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 
566 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  30.41 
 
 
537 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.57 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  25.87 
 
 
566 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31 
 
 
495 aa  196  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.47 
 
 
526 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  30 
 
 
581 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.82 
 
 
502 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.43 
 
 
501 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.06 
 
 
641 aa  194  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  42.62 
 
 
284 aa  194  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  26.87 
 
 
481 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.79 
 
 
550 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  31.41 
 
 
493 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  31.75 
 
 
510 aa  190  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.25 
 
 
568 aa  190  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.09 
 
 
490 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.63 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.8 
 
 
479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 
569 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.57 
 
 
483 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.06 
 
 
573 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
558 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.43 
 
 
810 aa  178  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.37 
 
 
279 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.38 
 
 
501 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  37.08 
 
 
288 aa  170  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.06 
 
 
562 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.73 
 
 
491 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.04 
 
 
558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  33.78 
 
 
494 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  23.96 
 
 
570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  23.96 
 
 
570 aa  168  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.04 
 
 
568 aa  167  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>