More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3550 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  100 
 
 		 605 aa  1224    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  41.92 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  38.81 
 
 		 593 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.34 
 
 		 568 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  36.68 
 
 		 576 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  39.16 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  38.28 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  38.28 
 
 		 569 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  37.59 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  36.93 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 630 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  39.89 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  38.46 
 
 		 541 aa  365  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  36.4 
 
 		 581 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  36.07 
 
 		 593 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  36.12 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  36.96 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 566 aa  339  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 571 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  33.61 
 
 		 641 aa  333  5e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  36.01 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  35.17 
 
 		 564 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.98 
 
 		 590 aa  327  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 		 566 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.22 
 
 		 548 aa  325  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  36.85 
 
 		 587 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  35.17 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.89 
 
 		 582 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 		 566 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  34.29 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  34.99 
 
 		 568 aa  319  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 568 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.87 
 
 		 568 aa  317  5e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 566 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  36.07 
 
 		 534 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.08 
 
 		 568 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  32.18 
 
 		 566 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.02 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 		 627 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 566 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.97 
 
 		 509 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 		 566 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 518 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  32.29 
 
 		 566 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.87 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.12 
 
 		 562 aa  299  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  32.78 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.7 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  33.84 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  33.84 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  34.54 
 
 		 478 aa  289  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.28 
 
 		 526 aa  289  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.27 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.58 
 
 		 641 aa  286  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  34.29 
 
 		 490 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.74 
 
 		 495 aa  283  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  33.78 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  33.92 
 
 		 493 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  33.39 
 
 		 530 aa  279  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.27 
 
 		 540 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.33 
 
 		 501 aa  277  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.33 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.67 
 
 		 550 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  33.78 
 
 		 500 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  31.53 
 
 		 585 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.84 
 
 		 535 aa  273  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.21 
 
 		 551 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.28 
 
 		 464 aa  267  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.79 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.52 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.27 
 
 		 543 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  32.18 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 		 553 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 		 551 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.54 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  32.3 
 
 		 628 aa  264  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 551 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  32.4 
 
 		 553 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.6 
 
 		 553 aa  261  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 		 551 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.71 
 
 		 479 aa  260  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 		 551 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.97 
 
 		 810 aa  257  4e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.26 
 
 		 512 aa  257  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  31.21 
 
 		 474 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 		 470 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  29.98 
 
 		 895 aa  252  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.77 
 
 		 530 aa  250  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 482 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.94 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>