More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1033 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  100 
 
 
512 aa  1025    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  56.59 
 
 
530 aa  596  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  40.76 
 
 
451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.03 
 
 
568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  33.71 
 
 
574 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.69 
 
 
531 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  34.02 
 
 
568 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  35.77 
 
 
510 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  34.53 
 
 
581 aa  266  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
630 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.9 
 
 
553 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.13 
 
 
571 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.26 
 
 
605 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
558 aa  256  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.98 
 
 
541 aa  256  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  33.77 
 
 
557 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.33 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.33 
 
 
566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.07 
 
 
566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 
566 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  35.32 
 
 
548 aa  252  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 
566 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 
566 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
566 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
581 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  34.27 
 
 
500 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.44 
 
 
550 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.58 
 
 
566 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.21 
 
 
571 aa  243  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.92 
 
 
593 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.41 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  33.87 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.19 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.44 
 
 
564 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.87 
 
 
534 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.85 
 
 
570 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.85 
 
 
570 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  35.98 
 
 
528 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.2 
 
 
537 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.69 
 
 
568 aa  238  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 
568 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  32.52 
 
 
574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.29 
 
 
489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.8 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.17 
 
 
573 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30 
 
 
490 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.73 
 
 
501 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  33.13 
 
 
483 aa  233  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.21 
 
 
518 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.02 
 
 
535 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.13 
 
 
471 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  33.13 
 
 
543 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 
491 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.06 
 
 
473 aa  229  8e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.38 
 
 
593 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.57 
 
 
576 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.84 
 
 
493 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 
502 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.15 
 
 
547 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.63 
 
 
497 aa  227  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.24 
 
 
509 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.4 
 
 
495 aa  223  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  34.39 
 
 
484 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  32.38 
 
 
764 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 
474 aa  219  7.999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.3 
 
 
590 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.11 
 
 
477 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  26.43 
 
 
502 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  33.2 
 
 
491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.43 
 
 
569 aa  217  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  31.9 
 
 
574 aa  217  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 
579 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.44 
 
 
463 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.2 
 
 
647 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.79 
 
 
497 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.64 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
540 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.63 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  30.74 
 
 
585 aa  213  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 
481 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
482 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.33 
 
 
569 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  31.28 
 
 
493 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.33 
 
 
569 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  31.05 
 
 
514 aa  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 
551 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  30.54 
 
 
510 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.18 
 
 
558 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  29.16 
 
 
467 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 
551 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.3 
 
 
553 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
551 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
551 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 
553 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  29.54 
 
 
482 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.34 
 
 
581 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.76 
 
 
541 aa  205  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  32.87 
 
 
517 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>