More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  59.15 
 
 		 585 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 641 aa  1269    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.65 
 
 		 605 aa  309  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 630 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 568 aa  300  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  33.06 
 
 		 641 aa  299  9e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  33.57 
 
 		 568 aa  298  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  34.69 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.31 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.65 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.09 
 
 		 593 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.58 
 
 		 548 aa  277  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.22 
 
 		 571 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.08 
 
 		 534 aa  273  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.9 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.59 
 
 		 550 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.36 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  36.31 
 
 		 510 aa  257  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.39 
 
 		 576 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  32.93 
 
 		 574 aa  250  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  36.19 
 
 		 547 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  34.78 
 
 		 582 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.58 
 
 		 509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.79 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 551 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  30.87 
 
 		 581 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.35 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 579 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.15 
 
 		 497 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  32.15 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.89 
 
 		 518 aa  239  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.07 
 
 		 564 aa  238  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  34.05 
 
 		 568 aa  236  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.68 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  31.77 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 		 553 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 551 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 		 551 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.73 
 
 		 464 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.11 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.11 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 551 aa  226  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.6 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 		 553 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 551 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  31.36 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.49 
 
 		 568 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.54 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.41 
 
 		 569 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 558 aa  223  9e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.91 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 553 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.38 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.02 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  33.7 
 
 		 581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.39 
 
 		 481 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  31.46 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.8 
 
 		 590 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  26.53 
 
 		 566 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.84 
 
 		 493 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  29.69 
 
 		 478 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.18 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  26.48 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  26.48 
 
 		 570 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  34.3 
 
 		 495 aa  211  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.89 
 
 		 543 aa  210  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  33.14 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.26 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.49 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  34.77 
 
 		 530 aa  208  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.23 
 
 		 537 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.04 
 
 		 568 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.06 
 
 		 495 aa  207  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.91 
 
 		 566 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.73 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.6 
 
 		 810 aa  207  6e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.74 
 
 		 497 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.72 
 
 		 491 aa  206  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.93 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  33.08 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.84 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.01 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 566 aa  204  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.01 
 
 		 566 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.73 
 
 		 501 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.36 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 566 aa  200  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 566 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.98 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.65 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.29 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.59 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>