More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1303 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  100 
 
 
481 aa  976    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  51.44 
 
 
497 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  48.01 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  47.93 
 
 
501 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  40.85 
 
 
647 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  35.81 
 
 
576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.47 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  36.26 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  37.43 
 
 
581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  37.08 
 
 
510 aa  300  5e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  36.2 
 
 
574 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
568 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  37.94 
 
 
569 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  37.94 
 
 
569 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.52 
 
 
593 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.7 
 
 
605 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  35.84 
 
 
571 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.54 
 
 
534 aa  286  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.91 
 
 
541 aa  286  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.6 
 
 
553 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  35.07 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  35.62 
 
 
574 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.94 
 
 
531 aa  272  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 
489 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  34.49 
 
 
469 aa  269  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.57 
 
 
548 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  35.99 
 
 
464 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.9 
 
 
582 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.87 
 
 
593 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.62 
 
 
581 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  30.89 
 
 
568 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.68 
 
 
579 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.61 
 
 
564 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.67 
 
 
501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.93 
 
 
493 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 
569 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
491 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  32.85 
 
 
497 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
566 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
566 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.61 
 
 
526 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  31.28 
 
 
490 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
491 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31 
 
 
518 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  34.95 
 
 
458 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  30.71 
 
 
547 aa  238  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 
566 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.49 
 
 
566 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 
566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.78 
 
 
810 aa  233  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.92 
 
 
566 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 
566 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
558 aa  232  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 
566 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 
568 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 
566 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.6 
 
 
568 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.33 
 
 
495 aa  229  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.87 
 
 
535 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.63 
 
 
537 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.87 
 
 
550 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.91 
 
 
566 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.81 
 
 
568 aa  226  7e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.35 
 
 
562 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
474 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 
770 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.22 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.25 
 
 
764 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.78 
 
 
473 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31 
 
 
498 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  32.08 
 
 
500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  32.24 
 
 
516 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.78 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 
551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.33 
 
 
495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  29.65 
 
 
463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.39 
 
 
528 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.39 
 
 
456 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  30.52 
 
 
530 aa  212  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.13 
 
 
541 aa  209  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  30.18 
 
 
540 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.24 
 
 
530 aa  209  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.89 
 
 
483 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
481 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 
470 aa  207  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 
502 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 
551 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 
551 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  31.02 
 
 
482 aa  203  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  30.23 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 
474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.24 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 
551 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.15 
 
 
450 aa  200  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 
553 aa  199  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.52 
 
 
628 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.74 
 
 
558 aa  199  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.44 
 
 
479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>