More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2045 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  100 
 
 
482 aa  944    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  67.02 
 
 
475 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  65.83 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  55.38 
 
 
512 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  51.79 
 
 
517 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  53.86 
 
 
492 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  55.38 
 
 
541 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  51.39 
 
 
539 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  51.04 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  51.04 
 
 
488 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  51.24 
 
 
488 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  48.87 
 
 
491 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  43.25 
 
 
895 aa  400  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  40.82 
 
 
510 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.27 
 
 
571 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.49 
 
 
541 aa  289  7e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  32.39 
 
 
574 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  37.79 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
568 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
484 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.77 
 
 
548 aa  273  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  35.17 
 
 
568 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.66 
 
 
558 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  37.04 
 
 
531 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  36.24 
 
 
557 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.33 
 
 
605 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.31 
 
 
495 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.91 
 
 
553 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.89 
 
 
593 aa  256  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 
566 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.84 
 
 
566 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  38.73 
 
 
764 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 
566 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  36.85 
 
 
810 aa  245  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.47 
 
 
568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.65 
 
 
566 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 
566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 
566 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  42.66 
 
 
494 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 
566 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  31.23 
 
 
593 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 
566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.64 
 
 
570 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.64 
 
 
570 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 
566 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 
467 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  33.47 
 
 
497 aa  237  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 
770 aa  236  7e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 
579 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.42 
 
 
569 aa  232  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.96 
 
 
811 aa  232  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.45 
 
 
518 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  36.69 
 
 
574 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.54 
 
 
568 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.67 
 
 
501 aa  230  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.32 
 
 
566 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  34.35 
 
 
512 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.66 
 
 
534 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 
568 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.4 
 
 
568 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.31 
 
 
558 aa  223  6e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  30.24 
 
 
466 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  30.24 
 
 
466 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 
551 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.42 
 
 
581 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.81 
 
 
576 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.01 
 
 
647 aa  216  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.91 
 
 
537 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.02 
 
 
481 aa  213  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 
551 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  33.68 
 
 
464 aa  213  9e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 
489 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.82 
 
 
501 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.65 
 
 
562 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.44 
 
 
564 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.5 
 
 
550 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.1 
 
 
573 aa  209  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  31.86 
 
 
582 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.16 
 
 
541 aa  209  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.43 
 
 
553 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.52 
 
 
558 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 
470 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  32.46 
 
 
500 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
551 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28.78 
 
 
491 aa  207  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 
553 aa  207  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.77 
 
 
458 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.96 
 
 
469 aa  206  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.48 
 
 
478 aa  206  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.78 
 
 
551 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
553 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
551 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.21 
 
 
581 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  33.92 
 
 
543 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 
551 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.24 
 
 
497 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.53 
 
 
590 aa  204  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 
491 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>