More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 558 aa  1050    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.9 
 
 		 811 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  42.81 
 
 		 574 aa  340  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  39.12 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.61 
 
 		 541 aa  249  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  30.72 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.94 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.5 
 
 		 605 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.95 
 
 		 568 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.16 
 
 		 531 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.54 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  27.99 
 
 		 630 aa  230  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  32.3 
 
 		 557 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  35.53 
 
 		 547 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  37.9 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  33.03 
 
 		 571 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  38 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  37.25 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  29.3 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  29.3 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.52 
 
 		 574 aa  220  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.15 
 
 		 510 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34 
 
 		 495 aa  217  4e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.47 
 
 		 497 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  36.51 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.01 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.95 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.95 
 
 		 528 aa  213  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  36.99 
 
 		 488 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  36.99 
 
 		 488 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  35.51 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 541 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.52 
 
 		 558 aa  212  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.29 
 
 		 497 aa  212  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 566 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 540 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  37.15 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.69 
 
 		 568 aa  211  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.47 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  39.39 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.77 
 
 		 550 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  36.47 
 
 		 488 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.52 
 
 		 593 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.04 
 
 		 548 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.12 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.92 
 
 		 566 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  35.24 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  32.7 
 
 		 895 aa  199  7.999999999999999e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.55 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.89 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.17 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.91 
 
 		 493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.4 
 
 		 537 aa  196  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.08 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 566 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.07 
 
 		 570 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  35.03 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.58 
 
 		 562 aa  195  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.07 
 
 		 570 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.73 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  27.63 
 
 		 474 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.27 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.75 
 
 		 590 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.59 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.85 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.38 
 
 		 647 aa  190  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.01 
 
 		 587 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.63 
 
 		 473 aa  190  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.54 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.08 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.01 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.61 
 
 		 581 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.41 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.54 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.24 
 
 		 568 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  27.74 
 
 		 593 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.53 
 
 		 481 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.37 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  32.46 
 
 		 471 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.04 
 
 		 581 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.36 
 
 		 810 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.31 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.79 
 
 		 627 aa  176  8e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 		 551 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  26.63 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 		 770 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.05 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>