More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0414 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  100 
 
 		 895 aa  1807    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  48.16 
 
 		 491 aa  459  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  44.55 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  43.19 
 
 		 517 aa  399  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  42.04 
 
 		 488 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  42.04 
 
 		 488 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  42.22 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  41.26 
 
 		 492 aa  362  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  40.33 
 
 		 512 aa  340  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 541 aa  331  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  41.62 
 
 		 475 aa  330  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  42.91 
 
 		 475 aa  327  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.21 
 
 		 574 aa  258  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.34 
 
 		 605 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.26 
 
 		 568 aa  243  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.82 
 
 		 571 aa  240  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0821  cobalt ABC transporter permease  48.15 
 
 		 275 aa  240  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.505848  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 		 770 aa  237  8e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.74 
 
 		 568 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.25 
 
 		 541 aa  234  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  26.49 
 
 		 810 aa  233  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.75 
 
 		 483 aa  231  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.67 
 
 		 557 aa  225  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 484 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  27.75 
 
 		 641 aa  220  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.51 
 
 		 553 aa  219  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 530 aa  218  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 566 aa  217  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 566 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 566 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.33 
 
 		 579 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  27.66 
 
 		 630 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.07 
 
 		 593 aa  214  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 566 aa  212  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 566 aa  212  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 627 aa  211  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 		 566 aa  210  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.26 
 
 		 510 aa  210  8e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.81 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.17 
 
 		 495 aa  210  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.35 
 
 		 593 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.83 
 
 		 568 aa  207  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.03 
 
 		 562 aa  206  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.45 
 
 		 569 aa  206  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.66 
 
 		 531 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.86 
 
 		 566 aa  205  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.62 
 
 		 566 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 566 aa  201  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.51 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.7 
 
 		 568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.22 
 
 		 537 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.7 
 
 		 568 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.47 
 
 		 558 aa  197  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.94 
 
 		 550 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  27.69 
 
 		 497 aa  195  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  27.99 
 
 		 467 aa  194  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  28.49 
 
 		 570 aa  192  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  28.49 
 
 		 570 aa  192  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.51 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  31.72 
 
 		 574 aa  188  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  29.43 
 
 		 582 aa  188  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 		 551 aa  185  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 		 553 aa  185  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28 
 
 		 576 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.15 
 
 		 553 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.88 
 
 		 581 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.08 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  29.53 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  27.63 
 
 		 466 aa  181  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  29.46 
 
 		 534 aa  180  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  27.63 
 
 		 466 aa  181  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.43 
 
 		 477 aa  180  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 		 551 aa  180  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.7 
 
 		 470 aa  178  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.53 
 
 		 528 aa  177  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 489 aa  177  8e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 		 553 aa  177  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  28.28 
 
 		 551 aa  177  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.27 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 		 551 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 553 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.05 
 
 		 479 aa  176  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  27.95 
 
 		 458 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  30.2 
 
 		 498 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.67 
 
 		 541 aa  174  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  30.68 
 
 		 497 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.22 
 
 		 581 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.5 
 
 		 502 aa  172  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.1 
 
 		 811 aa  172  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  26.85 
 
 		 518 aa  171  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.6 
 
 		 656 aa  171  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.93 
 
 		 590 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 571 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.38 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.21 
 
 		 647 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.43 
 
 		 574 aa  165  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>