More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3100 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  100 
 
 		 477 aa  964    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.37 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  33.98 
 
 		 478 aa  242  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.64 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 		 509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.67 
 
 		 510 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.03 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.98 
 
 		 564 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.96 
 
 		 770 aa  230  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 		 551 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  31.36 
 
 		 490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.78 
 
 		 568 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 		 491 aa  226  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.73 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.23 
 
 		 571 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  32.47 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.69 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.69 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.22 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.53 
 
 		 531 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.43 
 
 		 568 aa  220  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 		 553 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  35.32 
 
 		 764 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  30.24 
 
 		 593 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.11 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.6 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.05 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.35 
 
 		 568 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 		 551 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  32.27 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.39 
 
 		 568 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.78 
 
 		 551 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 489 aa  213  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  35.68 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  35.68 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.01 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.51 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.73 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.57 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.98 
 
 		 647 aa  210  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.7 
 
 		 495 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 		 551 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  34.66 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  32.24 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  33.33 
 
 		 456 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.49 
 
 		 557 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.26 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.26 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  31.55 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.57 
 
 		 568 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  35.26 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.27 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  30.67 
 
 		 537 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  31.47 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.42 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.38 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.55 
 
 		 534 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  32.68 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.75 
 
 		 581 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.46 
 
 		 810 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 482 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.46 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.41 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.31 
 
 		 579 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  31.61 
 
 		 491 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.97 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.19 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  32.05 
 
 		 516 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.98 
 
 		 1091 aa  190  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.47 
 
 		 562 aa  189  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.53 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.98 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  29.6 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  25.87 
 
 		 566 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  32.65 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  29.78 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 		 566 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.55 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 		 481 aa  186  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.61 
 
 		 566 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.34 
 
 		 571 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.24 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.27 
 
 		 585 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  25.42 
 
 		 566 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.94 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  25.72 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  32.56 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.47 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.72 
 
 		 566 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  24.85 
 
 		 566 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  33.06 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>