More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0259 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  954    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  45.53 
 
 
501 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  37.48 
 
 
531 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.68 
 
 
553 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  34.49 
 
 
481 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34.5 
 
 
510 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  34.68 
 
 
557 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.79 
 
 
534 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.83 
 
 
526 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.62 
 
 
548 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.78 
 
 
571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.95 
 
 
479 aa  249  5e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  34.87 
 
 
478 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  33.4 
 
 
647 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.38 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  34.96 
 
 
516 aa  244  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
489 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.65 
 
 
501 aa  240  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.9 
 
 
509 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.87 
 
 
550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  33.06 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 
502 aa  230  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.33 
 
 
537 aa  229  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
551 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  32.77 
 
 
464 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
491 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.83 
 
 
581 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.43 
 
 
493 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.08 
 
 
564 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  30.12 
 
 
491 aa  223  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.12 
 
 
530 aa  222  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.6 
 
 
470 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  31.54 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  33.06 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 
551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
551 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.62 
 
 
495 aa  219  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.45 
 
 
543 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 
553 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 
551 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  34.53 
 
 
491 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
551 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.66 
 
 
518 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.96 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.9 
 
 
573 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  31.71 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.02 
 
 
568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  30.52 
 
 
541 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.18 
 
 
553 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.09 
 
 
535 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
551 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.41 
 
 
553 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  26.91 
 
 
566 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  30.8 
 
 
510 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.24 
 
 
579 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 
474 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 
566 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.16 
 
 
568 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  33.33 
 
 
451 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 
566 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  30.77 
 
 
497 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 
566 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.53 
 
 
498 aa  204  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 
566 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 
474 aa  202  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  30.83 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.45 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.2 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  30.63 
 
 
494 aa  200  5e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 
566 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  30.84 
 
 
549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.13 
 
 
1091 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.96 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.22 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.22 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.15 
 
 
458 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.68 
 
 
558 aa  196  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.85 
 
 
473 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  28.44 
 
 
568 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  29.75 
 
 
482 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.92 
 
 
483 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.4 
 
 
512 aa  192  9e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.43 
 
 
463 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.32 
 
 
471 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.08 
 
 
569 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.36 
 
 
528 aa  190  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  30.91 
 
 
490 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  29.67 
 
 
764 aa  189  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26 
 
 
566 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 
770 aa  189  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  30.55 
 
 
477 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  30 
 
 
539 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.29 
 
 
566 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  30.37 
 
 
493 aa  186  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.82 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.66 
 
 
484 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  29.87 
 
 
488 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  29.87 
 
 
488 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>