More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4772 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  100 
 
 
500 aa  1009    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  51.02 
 
 
514 aa  498  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.91 
 
 
1091 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  49.9 
 
 
510 aa  455  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  49.68 
 
 
470 aa  449  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  49.68 
 
 
493 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
489 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.11 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  46.15 
 
 
490 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  48.35 
 
 
497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  44.16 
 
 
537 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.05 
 
 
473 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
502 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  45.35 
 
 
493 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
502 aa  360  3e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  43.74 
 
 
471 aa  360  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  42.29 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 
474 aa  347  3e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  38 
 
 
463 aa  338  9e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  43.52 
 
 
491 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  40.51 
 
 
516 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
491 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  38.88 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  42.14 
 
 
494 aa  320  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  41.85 
 
 
482 aa  319  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  40.6 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  39.05 
 
 
498 aa  313  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
481 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  40.09 
 
 
490 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  36.7 
 
 
464 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.78 
 
 
605 aa  274  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  36.04 
 
 
553 aa  272  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  35.26 
 
 
531 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.34 
 
 
557 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.53 
 
 
526 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  33.76 
 
 
587 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  33 
 
 
530 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  34.27 
 
 
512 aa  247  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.89 
 
 
510 aa  247  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  35.37 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.22 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.71 
 
 
574 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.47 
 
 
534 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.52 
 
 
571 aa  236  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  31.95 
 
 
582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  33.59 
 
 
581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  34.28 
 
 
548 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  33 
 
 
518 aa  232  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
551 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.05 
 
 
541 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.4 
 
 
530 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.77 
 
 
564 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.36 
 
 
573 aa  221  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  33.06 
 
 
469 aa  221  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  33.73 
 
 
551 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 
553 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
551 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  32.94 
 
 
553 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 
551 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.58 
 
 
495 aa  219  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.67 
 
 
593 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.89 
 
 
568 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
551 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.77 
 
 
568 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.08 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 
566 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.27 
 
 
477 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 
551 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.73 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.92 
 
 
566 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.4 
 
 
566 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.81 
 
 
568 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.27 
 
 
550 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
566 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.92 
 
 
535 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.24 
 
 
497 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.29 
 
 
579 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
566 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.71 
 
 
566 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.35 
 
 
574 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 
558 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.4 
 
 
576 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.17 
 
 
509 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.31 
 
 
543 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.65 
 
 
593 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.7 
 
 
569 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.73 
 
 
571 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.82 
 
 
501 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
467 aa  201  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  30.36 
 
 
581 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.62 
 
 
581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.45 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.64 
 
 
562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  30.17 
 
 
569 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>