More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4409 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  75.57 
 
 		 582 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  100 
 
 		 568 aa  1134    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  41.95 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.85 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  34.33 
 
 		 568 aa  326  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.33 
 
 		 571 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.08 
 
 		 605 aa  310  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.57 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 568 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.15 
 
 		 593 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  33.71 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.89 
 
 		 497 aa  301  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  35.83 
 
 		 548 aa  299  9e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  35.35 
 
 		 581 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  35.09 
 
 		 569 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  35.09 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  33.95 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  34.09 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 627 aa  276  6e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.58 
 
 		 553 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  34.1 
 
 		 493 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.96 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.89 
 
 		 481 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.33 
 
 		 541 aa  257  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  29.9 
 
 		 641 aa  256  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.59 
 
 		 569 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.28 
 
 		 564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 489 aa  253  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  36.75 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.19 
 
 		 501 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.71 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.08 
 
 		 530 aa  249  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  37.27 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 581 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 491 aa  246  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  33.58 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.82 
 
 		 534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.91 
 
 		 593 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  32.22 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  35.48 
 
 		 543 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.76 
 
 		 566 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.06 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.38 
 
 		 566 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.16 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.14 
 
 		 501 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.55 
 
 		 647 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.81 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.57 
 
 		 566 aa  233  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 540 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.74 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  26.68 
 
 		 502 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.25 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.81 
 
 		 566 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.06 
 
 		 473 aa  227  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.7 
 
 		 568 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  35.51 
 
 		 547 aa  226  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  32.66 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.86 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.15 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  35.03 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  38.76 
 
 		 288 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 		 551 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.39 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.41 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.73 
 
 		 628 aa  222  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.37 
 
 		 590 aa  223  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  33.15 
 
 		 524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1646  ABC transporter related  34.82 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  32.07 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.7 
 
 		 550 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  30.7 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.39 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 551 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.28 
 
 		 568 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.55 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.53 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.53 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.95 
 
 		 551 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.79 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.39 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.76 
 
 		 553 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.36 
 
 		 580 aa  213  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.91 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.31 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 553 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 482 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  33.33 
 
 		 514 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  26.88 
 
 		 570 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>