More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 		 473 aa  967    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.49 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  45.05 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  44.54 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  42.53 
 
 		 493 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  44 
 
 		 497 aa  352  5.9999999999999994e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.98 
 
 		 1091 aa  339  5.9999999999999996e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  41.14 
 
 		 514 aa  335  7.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  39.53 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  42.12 
 
 		 516 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  37.99 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  37.92 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  39.29 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  36.76 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 491 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  40.65 
 
 		 491 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  39.92 
 
 		 494 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  39.07 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  32.7 
 
 		 463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  37.05 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  36.5 
 
 		 482 aa  272  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  34.3 
 
 		 498 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  34.97 
 
 		 481 aa  259  8e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  37.83 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.85 
 
 		 495 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 491 aa  243  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.02 
 
 		 605 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.6 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  32.05 
 
 		 530 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.07 
 
 		 534 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.36 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.32 
 
 		 566 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.08 
 
 		 582 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.06 
 
 		 512 aa  229  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.06 
 
 		 568 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 568 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.52 
 
 		 548 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.46 
 
 		 562 aa  224  4e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.24 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  33.6 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 		 566 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.38 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  33.72 
 
 		 557 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.56 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.78 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.21 
 
 		 550 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.08 
 
 		 558 aa  216  9e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.95 
 
 		 566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 		 566 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.76 
 
 		 566 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.87 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.5 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.89 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.2 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.5 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.85 
 
 		 566 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 566 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.49 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.62 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.27 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.63 
 
 		 647 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 558 aa  206  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.33 
 
 		 483 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.66 
 
 		 535 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 571 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.77 
 
 		 574 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29 
 
 		 573 aa  202  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.02 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  31.16 
 
 		 764 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.37 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.92 
 
 		 551 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.92 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.08 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  34.11 
 
 		 547 aa  200  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.94 
 
 		 510 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.49 
 
 		 553 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.23 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.27 
 
 		 593 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.6 
 
 		 530 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.85 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.98 
 
 		 551 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 551 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.92 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  30.6 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 		 579 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>