More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2158 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
502 aa  1004    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  45.89 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  42.41 
 
 
490 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  42.24 
 
 
500 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  36.36 
 
 
495 aa  345  8e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  37.42 
 
 
493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 
491 aa  343  5e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
502 aa  341  1e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
474 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  36 
 
 
497 aa  334  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  35.33 
 
 
491 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  37.55 
 
 
514 aa  325  9e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  35.25 
 
 
516 aa  322  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.97 
 
 
479 aa  322  8e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  37.18 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
470 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.5 
 
 
1091 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  35.73 
 
 
537 aa  313  5.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  35.43 
 
 
510 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  36.44 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 
481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  36.82 
 
 
482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.74 
 
 
473 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  37.74 
 
 
463 aa  300  5e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  33.2 
 
 
498 aa  286  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.03 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  30.82 
 
 
582 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  33.94 
 
 
490 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.07 
 
 
553 aa  269  8e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
518 aa  267  4e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  35.39 
 
 
490 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  34.92 
 
 
494 aa  263  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.87 
 
 
501 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.78 
 
 
574 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  29.53 
 
 
568 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.39 
 
 
605 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.62 
 
 
571 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.31 
 
 
531 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  28.85 
 
 
568 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.06 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.08 
 
 
526 aa  244  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.18 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  27.62 
 
 
593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  32.43 
 
 
568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.14 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.45 
 
 
530 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 
551 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  31.02 
 
 
569 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  30.3 
 
 
571 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.65 
 
 
548 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.93 
 
 
557 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.91 
 
 
469 aa  230  5e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
566 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.1 
 
 
576 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  27.26 
 
 
568 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
568 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.87 
 
 
587 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
553 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  32.56 
 
 
551 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.83 
 
 
512 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
553 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.16 
 
 
551 aa  227  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.17 
 
 
551 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 
566 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.92 
 
 
497 aa  226  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.75 
 
 
558 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.6 
 
 
581 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
551 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
566 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
566 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.99 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.63 
 
 
566 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 
553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.19 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.31 
 
 
764 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.98 
 
 
541 aa  219  7e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  32.17 
 
 
553 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.99 
 
 
566 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 
551 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.22 
 
 
568 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.46 
 
 
550 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.75 
 
 
579 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.36 
 
 
573 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  28.71 
 
 
540 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.59 
 
 
534 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.08 
 
 
581 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  30.44 
 
 
543 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.63 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.87 
 
 
593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  28.18 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.93 
 
 
570 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.93 
 
 
570 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.02 
 
 
569 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.02 
 
 
569 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.4 
 
 
562 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  29.96 
 
 
530 aa  210  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.29 
 
 
580 aa  209  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>