More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3450 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  75.57 
 
 
568 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  100 
 
 
582 aa  1159    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  42.64 
 
 
574 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
571 aa  392  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.04 
 
 
568 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.94 
 
 
571 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  37.04 
 
 
557 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.89 
 
 
605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  34.43 
 
 
593 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.99 
 
 
574 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  34.2 
 
 
576 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
568 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
627 aa  297  3e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34.01 
 
 
510 aa  291  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  34.44 
 
 
581 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  30.82 
 
 
502 aa  283  7.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  35.32 
 
 
548 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  32.96 
 
 
569 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  32.96 
 
 
569 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 
630 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.9 
 
 
553 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  31.18 
 
 
641 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.9 
 
 
481 aa  264  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  36.5 
 
 
497 aa  259  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.9 
 
 
541 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.28 
 
 
581 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  33.08 
 
 
564 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.67 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  32.51 
 
 
493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  36.68 
 
 
535 aa  252  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
566 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.57 
 
 
537 aa  247  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  37 
 
 
547 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.98 
 
 
534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.15 
 
 
526 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  36.18 
 
 
543 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.59 
 
 
531 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.81 
 
 
569 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  34.2 
 
 
540 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.73 
 
 
491 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.54 
 
 
566 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
566 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 
566 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
502 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  28.88 
 
 
593 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 
566 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  32.73 
 
 
587 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.76 
 
 
501 aa  238  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  36.82 
 
 
530 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.86 
 
 
566 aa  236  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  34.21 
 
 
495 aa  236  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.49 
 
 
530 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.36 
 
 
566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
581 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  31.64 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  31.95 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.49 
 
 
566 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
579 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.36 
 
 
566 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.47 
 
 
490 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.25 
 
 
647 aa  230  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.24 
 
 
641 aa  230  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.52 
 
 
550 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.69 
 
 
568 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.08 
 
 
473 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.39 
 
 
810 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  33.64 
 
 
585 aa  228  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  38.03 
 
 
288 aa  227  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  31.47 
 
 
628 aa  226  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.83 
 
 
566 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  32.06 
 
 
491 aa  224  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.32 
 
 
568 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.39 
 
 
590 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  33.09 
 
 
524 aa  223  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1646  ABC transporter related  32.74 
 
 
556 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.37 
 
 
551 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
551 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
551 aa  220  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.2 
 
 
458 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 
558 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.17 
 
 
580 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.42 
 
 
770 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 
551 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.07 
 
 
551 aa  213  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.06 
 
 
547 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.02 
 
 
553 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  32.44 
 
 
570 aa  211  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
474 aa  211  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.02 
 
 
551 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.21 
 
 
495 aa  211  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.65 
 
 
553 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  32.41 
 
 
539 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.93 
 
 
562 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.97 
 
 
553 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  32.16 
 
 
517 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.16 
 
 
553 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.46 
 
 
573 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  31.68 
 
 
510 aa  203  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.66 
 
 
568 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  29.02 
 
 
549 aa  200  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>