More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0055 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 
770 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  100 
 
 
810 aa  1623    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  38.76 
 
 
628 aa  347  6e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  34.22 
 
 
574 aa  281  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  33.91 
 
 
568 aa  273  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.38 
 
 
571 aa  271  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
568 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  35.85 
 
 
541 aa  262  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.16 
 
 
553 aa  260  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.97 
 
 
605 aa  257  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  31.5 
 
 
593 aa  254  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  36.52 
 
 
557 aa  254  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  35.28 
 
 
458 aa  250  8e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.38 
 
 
509 aa  242  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
482 aa  237  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.42 
 
 
551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  32.02 
 
 
490 aa  234  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.04 
 
 
548 aa  234  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  33.78 
 
 
481 aa  232  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.62 
 
 
501 aa  232  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.81 
 
 
647 aa  232  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.93 
 
 
497 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.39 
 
 
582 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.23 
 
 
531 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  26.25 
 
 
895 aa  226  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  31.12 
 
 
576 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  29.03 
 
 
641 aa  225  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  30.93 
 
 
501 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  31.8 
 
 
456 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.9 
 
 
568 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
553 aa  220  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
553 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
551 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.21 
 
 
534 aa  220  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  35.31 
 
 
488 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  35.31 
 
 
488 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  31.81 
 
 
587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
553 aa  217  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.83 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.6 
 
 
593 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  33.68 
 
 
491 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  33.99 
 
 
517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  32.38 
 
 
581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.48 
 
 
526 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  35.7 
 
 
488 aa  214  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.43 
 
 
495 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  31.07 
 
 
564 aa  213  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.09 
 
 
537 aa  213  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.87 
 
 
518 aa  211  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  31.89 
 
 
510 aa  210  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  32.21 
 
 
550 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.35 
 
 
478 aa  208  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.18 
 
 
569 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.72 
 
 
581 aa  207  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.18 
 
 
569 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  33.7 
 
 
539 aa  207  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.99 
 
 
579 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.47 
 
 
493 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  32.58 
 
 
553 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.41 
 
 
568 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  31.98 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.66 
 
 
490 aa  200  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  31.99 
 
 
557 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  25.28 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.88 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  33.27 
 
 
497 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.6 
 
 
550 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.02 
 
 
558 aa  197  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  32.73 
 
 
560 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  30.77 
 
 
542 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.33 
 
 
547 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  35.12 
 
 
566 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  30.44 
 
 
549 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  32.77 
 
 
565 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  32.03 
 
 
546 aa  195  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 
502 aa  195  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 
548 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2487  ABC transporter related protein  30.1 
 
 
944 aa  195  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.053528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.09 
 
 
530 aa  194  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  31.02 
 
 
548 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.31 
 
 
562 aa  192  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0157  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
675 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  32.25 
 
 
571 aa  192  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  31.14 
 
 
548 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.18 
 
 
479 aa  191  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.58 
 
 
278 aa  191  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  31.73 
 
 
534 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.78 
 
 
585 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.1 
 
 
540 aa  188  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  46.05 
 
 
273 aa  188  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 
281 aa  188  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  31.6 
 
 
510 aa  188  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  41.99 
 
 
290 aa  187  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  33.2 
 
 
549 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  32.48 
 
 
535 aa  187  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 
470 aa  187  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.36 
 
 
530 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>