More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1835 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 568 aa  1140    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  96.83 
 
 		 568 aa  1113    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  52.31 
 
 		 593 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  52.22 
 
 		 579 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  51.85 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  51.85 
 
 		 570 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  52.92 
 
 		 558 aa  585  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  52.04 
 
 		 573 aa  588  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  53.42 
 
 		 568 aa  569  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 569 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 566 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  49.64 
 
 		 566 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  49.38 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.98 
 
 		 590 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  49.29 
 
 		 566 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  48.93 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  48.93 
 
 		 566 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 566 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.09 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 541 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 568 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.23 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  38.03 
 
 		 574 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.78 
 
 		 571 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  34.81 
 
 		 605 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  34.26 
 
 		 568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 		 630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.4 
 
 		 593 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.96 
 
 		 497 aa  273  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  32.51 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.48 
 
 		 510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.63 
 
 		 541 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.63 
 
 		 550 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.23 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  30.29 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 530 aa  266  8.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  31.38 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  33.21 
 
 		 518 aa  259  8e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.05 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  26.03 
 
 		 641 aa  255  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 		 627 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.77 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.04 
 
 		 526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.88 
 
 		 495 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.07 
 
 		 509 aa  251  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.28 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  28.15 
 
 		 571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  30.84 
 
 		 569 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.38 
 
 		 564 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.12 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 770 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.88 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.29 
 
 		 490 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.31 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.86 
 
 		 491 aa  235  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.38 
 
 		 481 aa  231  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.69 
 
 		 493 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  27.77 
 
 		 574 aa  229  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  27.7 
 
 		 547 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  28.14 
 
 		 534 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 551 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.47 
 
 		 483 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  32.23 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  27.76 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  27.32 
 
 		 582 aa  223  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.72 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  26.44 
 
 		 581 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  27.89 
 
 		 540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.3 
 
 		 501 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  26.39 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  29.26 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.58 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.53 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  29 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.62 
 
 		 551 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.04 
 
 		 647 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  27.39 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 474 aa  213  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  29.94 
 
 		 484 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 482 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  27.04 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 		 551 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 489 aa  210  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 		 551 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.5 
 
 		 473 aa  210  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.42 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.24 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.51 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  28.81 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  27.97 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.49 
 
 		 497 aa  207  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>