More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1694 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  100 
 
 
497 aa  1001    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  56.51 
 
 
509 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  51.25 
 
 
478 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  51.44 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  50 
 
 
501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  44.79 
 
 
647 aa  424  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.95 
 
 
568 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  39.38 
 
 
557 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.88 
 
 
571 aa  350  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  39.48 
 
 
574 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.12 
 
 
605 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  36.28 
 
 
593 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  37.3 
 
 
576 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
568 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  37.62 
 
 
581 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  36.06 
 
 
553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  37.68 
 
 
510 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  36.38 
 
 
569 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  36.38 
 
 
569 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.89 
 
 
568 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  36.97 
 
 
534 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  38.57 
 
 
548 aa  298  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  35.62 
 
 
574 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  34.89 
 
 
541 aa  293  6e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
571 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  35.74 
 
 
501 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  34.97 
 
 
581 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  34.38 
 
 
564 aa  289  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.86 
 
 
531 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.29 
 
 
593 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 
569 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.87 
 
 
579 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
566 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.02 
 
 
568 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.66 
 
 
566 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
568 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 
566 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 
566 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
566 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
491 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.66 
 
 
566 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 
566 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.49 
 
 
568 aa  265  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  29.84 
 
 
566 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
566 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  33.75 
 
 
493 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
491 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  36.27 
 
 
458 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  34.01 
 
 
483 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  34.08 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.67 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  30.27 
 
 
570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  30.27 
 
 
570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.18 
 
 
495 aa  255  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
530 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  33.2 
 
 
490 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.43 
 
 
573 aa  252  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.1 
 
 
562 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  33.47 
 
 
535 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.75 
 
 
495 aa  249  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
489 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.82 
 
 
518 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  35.11 
 
 
516 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  32.38 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  33.13 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.37 
 
 
541 aa  244  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.13 
 
 
526 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  30.99 
 
 
547 aa  243  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  34.06 
 
 
543 aa  243  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  31.84 
 
 
628 aa  242  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
770 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  32.78 
 
 
471 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  32.22 
 
 
764 aa  240  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.13 
 
 
550 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.64 
 
 
477 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 
474 aa  238  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  30.77 
 
 
587 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
540 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.2 
 
 
558 aa  233  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  31.24 
 
 
581 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.36 
 
 
473 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.43 
 
 
537 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 
551 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.93 
 
 
810 aa  229  8e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
482 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.36 
 
 
464 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.63 
 
 
512 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33 
 
 
530 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
502 aa  226  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
474 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.21 
 
 
479 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  31.7 
 
 
510 aa  223  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.61 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  29.87 
 
 
585 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  32.85 
 
 
456 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.18 
 
 
641 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 
551 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  29.65 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0776584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>