More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1603 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 481 aa  981    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  52.19 
 
 		 482 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  41.65 
 
 		 490 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  40.95 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 502 aa  319  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  39.36 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  38.66 
 
 		 514 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  37.09 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 502 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  37.23 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 491 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  38.45 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  37.05 
 
 		 493 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  37.37 
 
 		 516 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.75 
 
 		 497 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  37.96 
 
 		 491 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  35.43 
 
 		 537 aa  283  5.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  35.6 
 
 		 498 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.81 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 491 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  35.29 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  37.04 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.57 
 
 		 1091 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.97 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  33.98 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  35.96 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.46 
 
 		 553 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  34.58 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  34.08 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  33.33 
 
 		 557 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  34.14 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.22 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.69 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.76 
 
 		 534 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.91 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 518 aa  216  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.96 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  31.16 
 
 		 581 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  29.84 
 
 		 547 aa  210  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.25 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 		 566 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 566 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 566 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.66 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  29.71 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.4 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.92 
 
 		 568 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.53 
 
 		 571 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 566 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 566 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.11 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.46 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  30.34 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.69 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.74 
 
 		 562 aa  199  6e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.25 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 568 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.94 
 
 		 568 aa  199  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 770 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.26 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.77 
 
 		 501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.02 
 
 		 564 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.96 
 
 		 568 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.65 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 566 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.84 
 
 		 647 aa  192  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.35 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  30.71 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.04 
 
 		 541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.35 
 
 		 535 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.08 
 
 		 579 aa  190  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.58 
 
 		 566 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.46 
 
 		 558 aa  188  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.65 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  27.72 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.09 
 
 		 541 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  28.21 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.57 
 
 		 573 aa  186  7e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  27.22 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  30.02 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.94 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  28.88 
 
 		 764 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.14 
 
 		 593 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 551 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  31.59 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  29.8 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.59 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  29.8 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.87 
 
 		 580 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.63 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 		 630 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  29.87 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.81 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.37 
 
 		 558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>