More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0131 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.28 
 
 
641 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  100 
 
 
585 aa  1181    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  30.27 
 
 
630 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.51 
 
 
568 aa  291  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.77 
 
 
568 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  28.95 
 
 
641 aa  283  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 
627 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.5 
 
 
571 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.58 
 
 
574 aa  280  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.04 
 
 
571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.33 
 
 
605 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.14 
 
 
553 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  31.68 
 
 
557 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.74 
 
 
548 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.91 
 
 
593 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  32.47 
 
 
587 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.29 
 
 
531 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  29.85 
 
 
574 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  30.57 
 
 
576 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  30.45 
 
 
569 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  30.45 
 
 
569 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  31.37 
 
 
541 aa  244  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  30.53 
 
 
581 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 
558 aa  242  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.96 
 
 
568 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  31.62 
 
 
534 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  30.05 
 
 
581 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.08 
 
 
569 aa  236  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.39 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.15 
 
 
551 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.42 
 
 
510 aa  230  6e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  31.23 
 
 
547 aa  229  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.11 
 
 
593 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
518 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 
579 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.35 
 
 
564 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.64 
 
 
582 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.31 
 
 
558 aa  226  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
551 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.18 
 
 
550 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
551 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
530 aa  226  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.18 
 
 
562 aa  226  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.48 
 
 
568 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 
551 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.87 
 
 
497 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.96 
 
 
551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 
553 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 
551 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.68 
 
 
526 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.77 
 
 
553 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  29.69 
 
 
540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 
568 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.43 
 
 
568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.9 
 
 
566 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  31.52 
 
 
581 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  26.37 
 
 
570 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  26.37 
 
 
570 aa  213  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.74 
 
 
512 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.26 
 
 
489 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.55 
 
 
566 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  26.95 
 
 
566 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.9 
 
 
566 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.79 
 
 
490 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.9 
 
 
566 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 
566 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.25 
 
 
495 aa  209  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.24 
 
 
566 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 
553 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.78 
 
 
590 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.5 
 
 
491 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  26.73 
 
 
566 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.09 
 
 
541 aa  206  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.75 
 
 
502 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.13 
 
 
566 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.5 
 
 
458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  30.64 
 
 
535 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.37 
 
 
479 aa  193  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.53 
 
 
493 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.28 
 
 
501 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.99 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  28.87 
 
 
549 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.93 
 
 
540 aa  190  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.36 
 
 
491 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.81 
 
 
810 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  30.74 
 
 
530 aa  188  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.89 
 
 
497 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  31.31 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.27 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.73 
 
 
647 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  28.35 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  31.49 
 
 
570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  28.97 
 
 
498 aa  184  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.64 
 
 
495 aa  184  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.58 
 
 
279 aa  183  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.35 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.68 
 
 
502 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  29.71 
 
 
491 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>