More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2396 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  100 
 
 		 456 aa  927    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  42.27 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  38.26 
 
 		 458 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  41.94 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  39.65 
 
 		 458 aa  277  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  41.71 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  40.65 
 
 		 455 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  40.68 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  38.85 
 
 		 454 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  39.77 
 
 		 448 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  39.77 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  39.77 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  39.31 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  39.54 
 
 		 456 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.23 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  36.9 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 568 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  32.4 
 
 		 810 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  35.58 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.85 
 
 		 497 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.47 
 
 		 553 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  32.78 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  32.03 
 
 		 481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  33.55 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  34.34 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.35 
 
 		 593 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 568 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  30.08 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.69 
 
 		 579 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.88 
 
 		 568 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.01 
 
 		 574 aa  206  9e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 770 aa  202  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.12 
 
 		 764 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.88 
 
 		 569 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  35.11 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.03 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 482 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.58 
 
 		 501 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.4 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  33.13 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.91 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  32.02 
 
 		 517 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.93 
 
 		 495 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.87 
 
 		 495 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  31.26 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  31.26 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.01 
 
 		 562 aa  186  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  27.38 
 
 		 605 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  32.47 
 
 		 539 aa  186  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  31.62 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  34.57 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  31.12 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 566 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.28 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.59 
 
 		 568 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.15 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.61 
 
 		 647 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 551 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  31.14 
 
 		 569 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.05 
 
 		 493 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  31.19 
 
 		 488 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.38 
 
 		 497 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  29.34 
 
 		 557 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.42 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.46 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  31.47 
 
 		 498 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  31.14 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  29.84 
 
 		 534 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.67 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.67 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  28.98 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 		 566 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 551 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  26.14 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  31.87 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  31.84 
 
 		 547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 		 566 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.08 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.77 
 
 		 479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.84 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.18 
 
 		 570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.18 
 
 		 570 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 		 566 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.91 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.91 
 
 		 566 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.74 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.85 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.52 
 
 		 566 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.6 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.8 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>