More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0095 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  100 
 
 
451 aa  909    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  65.14 
 
 
458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  57.92 
 
 
454 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.76 
 
 
464 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  55.63 
 
 
456 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  55.41 
 
 
456 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  55.18 
 
 
456 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  56.28 
 
 
455 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  54.95 
 
 
456 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  56.28 
 
 
455 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  53.67 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  54.3 
 
 
454 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 
454 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  42.83 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  42.27 
 
 
456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  36.2 
 
 
458 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  36.13 
 
 
476 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.57 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.12 
 
 
497 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.53 
 
 
495 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.72 
 
 
553 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 
770 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.37 
 
 
810 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.35 
 
 
531 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  28.49 
 
 
605 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.17 
 
 
479 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.04 
 
 
1091 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.89 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  30.43 
 
 
539 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  28.78 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  28.81 
 
 
490 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 
491 aa  173  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.1 
 
 
509 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  28.94 
 
 
490 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.33 
 
 
500 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.85 
 
 
493 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.4 
 
 
568 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.42 
 
 
537 aa  170  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  29.96 
 
 
517 aa  170  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.16 
 
 
483 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  28.08 
 
 
494 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.71 
 
 
558 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.42 
 
 
497 aa  167  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  27.95 
 
 
593 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.3 
 
 
534 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.96 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.76 
 
 
593 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  26.72 
 
 
570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 
502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  26.72 
 
 
570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.02 
 
 
564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.03 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  30.51 
 
 
960 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.39 
 
 
484 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.97 
 
 
467 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  27.62 
 
 
478 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  28.44 
 
 
490 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.98 
 
 
558 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  27.4 
 
 
647 aa  160  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
491 aa  159  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  28.51 
 
 
491 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.07 
 
 
501 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  26.19 
 
 
481 aa  159  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  27.95 
 
 
471 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  30.27 
 
 
535 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  26.94 
 
 
557 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  30.77 
 
 
512 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 
551 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.02 
 
 
495 aa  156  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.59 
 
 
473 aa  156  7e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.8 
 
 
566 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.12 
 
 
568 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  26.74 
 
 
498 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  27.78 
 
 
510 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  29.05 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  28.12 
 
 
571 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  28.1 
 
 
477 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  28.67 
 
 
514 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
566 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  30.5 
 
 
543 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  30.28 
 
 
966 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.68 
 
 
566 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 
481 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.68 
 
 
566 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  27.29 
 
 
466 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  27.29 
 
 
466 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 
566 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  26.43 
 
 
474 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  24.49 
 
 
518 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.76 
 
 
573 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  30.23 
 
 
540 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.59 
 
 
566 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.92 
 
 
501 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.92 
 
 
457 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  25.88 
 
 
474 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  29.74 
 
 
488 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  29.74 
 
 
488 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  26.91 
 
 
510 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>