More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4087 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  100 
 
 		 454 aa  912    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  57.8 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  59.68 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  57.92 
 
 		 451 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  59.68 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  57.58 
 
 		 455 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  59.46 
 
 		 456 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.31 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  59.46 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  56.58 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  57.05 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  56.88 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  55.1 
 
 		 454 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  43.97 
 
 		 496 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  38.85 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  34.37 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  36.34 
 
 		 476 aa  216  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 770 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.29 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.76 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  29.37 
 
 		 537 aa  180  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.98 
 
 		 810 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.46 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  27.04 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.19 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  27.18 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.44 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  27.46 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.33 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.43 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  25.55 
 
 		 463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  29.56 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  27.59 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.25 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.54 
 
 		 647 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.27 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.28 
 
 		 471 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.63 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  30.25 
 
 		 490 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.08 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 		 474 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  29.54 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  28.96 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  29.74 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.62 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  29.88 
 
 		 587 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 541 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.74 
 
 		 490 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  30.27 
 
 		 960 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.33 
 
 		 493 aa  156  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  28.69 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  27.61 
 
 		 557 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.51 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  26.29 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 		 566 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.33 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.04 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.13 
 
 		 566 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.08 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.43 
 
 		 568 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  29.65 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.9 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.54 
 
 		 489 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  27.79 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  28.91 
 
 		 510 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  27.1 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 		 568 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.72 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  26.85 
 
 		 566 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  25.81 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.6 
 
 		 535 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.69 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  28.91 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  27.86 
 
 		 524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  26.96 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.87 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  28.91 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.69 
 
 		 502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  26.37 
 
 		 571 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  27.8 
 
 		 540 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  28.18 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.41 
 
 		 566 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.48 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.04 
 
 		 558 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  27.08 
 
 		 566 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  27.77 
 
 		 569 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  27.61 
 
 		 477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  28.28 
 
 		 581 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  28.11 
 
 		 581 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.74 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  27.77 
 
 		 569 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  29.26 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  25.56 
 
 		 570 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  25.56 
 
 		 570 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>