More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3866 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  74.73 
 
 		 464 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  81.88 
 
 		 456 aa  748    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  81.66 
 
 		 456 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  81.66 
 
 		 456 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  81.88 
 
 		 456 aa  749    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  76.44 
 
 		 448 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  100 
 
 		 455 aa  914    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  98.24 
 
 		 455 aa  897    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  87 
 
 		 454 aa  795    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  57.58 
 
 		 454 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  57.62 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  56.28 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  52.98 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  42.92 
 
 		 496 aa  322  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  40.65 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  35.23 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  38.69 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  29.3 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.96 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  27.92 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.01 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.29 
 
 		 450 aa  170  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  28.94 
 
 		 498 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.37 
 
 		 497 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  27.25 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  27.95 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 770 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.18 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.07 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.72 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.51 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  27.46 
 
 		 497 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  26.5 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 484 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.67 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  29.27 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.42 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.51 
 
 		 473 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.23 
 
 		 571 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.45 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  29.23 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.98 
 
 		 576 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.73 
 
 		 810 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  29.36 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.25 
 
 		 764 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.62 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  29.57 
 
 		 960 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  28.96 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.82 
 
 		 501 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.29 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.43 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  24.44 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  26.24 
 
 		 490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.43 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.41 
 
 		 558 aa  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  26.89 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.41 
 
 		 479 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.9 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.79 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 551 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  24.5 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  25.83 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  26.04 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 551 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.05 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.7 
 
 		 568 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 551 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.31 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  29.17 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  28.83 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  30.74 
 
 		 512 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 551 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  28.48 
 
 		 551 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  26.12 
 
 		 478 aa  146  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  26.09 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.65 
 
 		 1091 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  28.48 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  26.1 
 
 		 574 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  25.7 
 
 		 647 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  26.1 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  25.97 
 
 		 500 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  29.36 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.72 
 
 		 558 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.08 
 
 		 581 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  24.85 
 
 		 566 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.06 
 
 		 495 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  28.98 
 
 		 524 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.03 
 
 		 526 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  29.29 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  27.29 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.62 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.6 
 
 		 547 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  26.91 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  31.17 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>