More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1474 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  100 
 
 		 476 aa  955    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  40.68 
 
 		 456 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  37.02 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  39.42 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  38.94 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  36.13 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  38.69 
 
 		 455 aa  242  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  37.62 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  37 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  37.24 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.47 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  36.77 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  36.34 
 
 		 454 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  36.45 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  35.87 
 
 		 496 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.69 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  32.26 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  34.33 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.01 
 
 		 509 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  31.36 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  33.26 
 
 		 764 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.56 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.46 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  28.33 
 
 		 483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.86 
 
 		 568 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  28.97 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  32.82 
 
 		 488 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  32.82 
 
 		 488 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  30.33 
 
 		 576 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  28.25 
 
 		 497 aa  169  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  30.22 
 
 		 516 aa  166  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 		 566 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  29.42 
 
 		 495 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.04 
 
 		 566 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.22 
 
 		 531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  32.52 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  29.09 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.28 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.43 
 
 		 568 aa  164  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.07 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  27.7 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.52 
 
 		 568 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  33.04 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.97 
 
 		 593 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.32 
 
 		 568 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  30.66 
 
 		 810 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.48 
 
 		 770 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.2 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 566 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.69 
 
 		 569 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  26.61 
 
 		 568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  26.31 
 
 		 566 aa  157  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.73 
 
 		 481 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  27.14 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  26.06 
 
 		 474 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.11 
 
 		 493 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.31 
 
 		 566 aa  156  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  29 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.11 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 		 579 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.9 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  31.15 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.69 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.73 
 
 		 464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  31.57 
 
 		 517 aa  153  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.28 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  27.97 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.62 
 
 		 495 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  30.98 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.49 
 
 		 548 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.09 
 
 		 457 aa  150  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  28.16 
 
 		 557 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  27.14 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.07 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  27.14 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.12 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.91 
 
 		 558 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  27.91 
 
 		 510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  26.41 
 
 		 628 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  30.88 
 
 		 966 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  31.56 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.26 
 
 		 647 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  24.47 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2059  ABC transporter related  28.51 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0776584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  27.83 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  30.8 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  25.21 
 
 		 518 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  25.96 
 
 		 571 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  26.06 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  30.56 
 
 		 492 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>