More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3624 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3624  ABC transporter related  100 
 
 		 966 aa  1851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  76.3 
 
 		 960 aa  1164    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  35.7 
 
 		 540 aa  221  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  35.45 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  36.75 
 
 		 535 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  36.23 
 
 		 530 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.52 
 
 		 547 aa  212  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  35.74 
 
 		 547 aa  212  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4401  hypothetical protein  50.44 
 
 		 298 aa  211  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.733207  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.49 
 
 		 490 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  30.69 
 
 		 531 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.21 
 
 		 551 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.92 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15970  hypothetical protein  46.72 
 
 		 283 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.354169  normal  0.289981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3429  integral membrane protein  48.76 
 
 		 273 aa  192  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 551 aa  188  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 551 aa  188  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 553 aa  187  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 551 aa  187  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.81 
 
 		 551 aa  186  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  29.13 
 
 		 553 aa  184  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 		 553 aa  183  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 		 553 aa  181  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.04 
 
 		 564 aa  180  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.88 
 
 		 501 aa  178  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  32.59 
 
 		 526 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17480  hypothetical protein  42.7 
 
 		 278 aa  174  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000911252  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.83 
 
 		 512 aa  174  6.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.78 
 
 		 469 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 470 aa  168  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.25 
 
 		 518 aa  168  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  29.94 
 
 		 541 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  32.31 
 
 		 764 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  30.5 
 
 		 451 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.51 
 
 		 495 aa  166  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.41 
 
 		 489 aa  165  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 474 aa  164  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  26.72 
 
 		 502 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  28.29 
 
 		 549 aa  163  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3112  hypothetical protein  44.76 
 
 		 274 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240687  normal  0.181566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  33.33 
 
 		 516 aa  162  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31.89 
 
 		 495 aa  162  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.38 
 
 		 647 aa  162  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  29.22 
 
 		 494 aa  161  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.71 
 
 		 493 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.64 
 
 		 500 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  31.04 
 
 		 451 aa  160  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  30.89 
 
 		 464 aa  159  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.14 
 
 		 530 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  30.56 
 
 		 449 aa  158  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.61 
 
 		 509 aa  157  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  28.05 
 
 		 557 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  32.07 
 
 		 486 aa  157  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2290  hypothetical protein  46.19 
 
 		 261 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  32.88 
 
 		 490 aa  155  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  23.25 
 
 		 463 aa  154  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  31.07 
 
 		 491 aa  154  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1420  ABC transporter related  29.74 
 
 		 553 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.317309  normal  0.7717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.24 
 
 		 471 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  32.58 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.49 
 
 		 479 aa  151  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  25.38 
 
 		 474 aa  151  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  30.16 
 
 		 528 aa  151  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.74 
 
 		 481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  29.15 
 
 		 458 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.86 
 
 		 481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  29.95 
 
 		 460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.51 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  27.77 
 
 		 478 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  28.68 
 
 		 514 aa  148  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.86 
 
 		 573 aa  148  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  26.88 
 
 		 576 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  25.47 
 
 		 502 aa  146  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  27.31 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  28.65 
 
 		 568 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  28.02 
 
 		 454 aa  145  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  27.33 
 
 		 537 aa  145  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.11 
 
 		 540 aa  145  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  29.24 
 
 		 498 aa  144  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  26.94 
 
 		 456 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  29.95 
 
 		 454 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  29.92 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  31.06 
 
 		 493 aa  142  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.19 
 
 		 477 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.22 
 
 		 497 aa  142  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  24.1 
 
 		 491 aa  141  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  31.09 
 
 		 476 aa  141  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  28.49 
 
 		 548 aa  141  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  30.6 
 
 		 524 aa  141  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.48 
 
 		 550 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.68 
 
 		 811 aa  140  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.31 
 
 		 1091 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  27.42 
 
 		 569 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  27.58 
 
 		 455 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.96 
 
 		 590 aa  140  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  26.73 
 
 		 456 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  26.67 
 
 		 569 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  26.73 
 
 		 456 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.07 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>