More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0072 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 		 450 aa  914    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.6 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  41.58 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.67 
 
 		 458 aa  302  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.95 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0173  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.32 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  35.57 
 
 		 451 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  29.15 
 
 		 481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  27.48 
 
 		 531 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  27.93 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  30.65 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.94 
 
 		 493 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  29.78 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.75 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.74 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 489 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 474 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.66 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  28.85 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  29.31 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  29.27 
 
 		 483 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  27.77 
 
 		 764 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.01 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 		 467 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  27.02 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.58 
 
 		 501 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  27.71 
 
 		 482 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  27.97 
 
 		 517 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  29.68 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.83 
 
 		 568 aa  176  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  30.41 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  28.08 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  30.41 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  29.98 
 
 		 455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  28.45 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.03 
 
 		 647 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.03 
 
 		 500 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 		 558 aa  172  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.83 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  29.25 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  29.02 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  30.19 
 
 		 454 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  28.22 
 
 		 474 aa  170  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  29.29 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  28.17 
 
 		 501 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  29.25 
 
 		 456 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  26.97 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  29.02 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 		 770 aa  168  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.41 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  26.37 
 
 		 541 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  29.37 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  26.72 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  26.72 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  29.25 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  26.07 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  26.11 
 
 		 564 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  27.14 
 
 		 488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  28.54 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.31 
 
 		 574 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.22 
 
 		 495 aa  163  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  27.48 
 
 		 477 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  26.6 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 		 569 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  25.68 
 
 		 553 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  26.78 
 
 		 574 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  32.95 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  28.54 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  29.28 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 		 502 aa  159  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.29 
 
 		 562 aa  159  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.17 
 
 		 566 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  29.25 
 
 		 494 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  26.81 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  29 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  26.03 
 
 		 557 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  25.83 
 
 		 566 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  25.84 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  25.98 
 
 		 566 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  26.85 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.48 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.05 
 
 		 537 aa  156  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  26.61 
 
 		 579 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  27.01 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  25.83 
 
 		 566 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.17 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.25 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.78 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.54 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.89 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  27.98 
 
 		 490 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  26.99 
 
 		 510 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  24.54 
 
 		 497 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  25.78 
 
 		 566 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>