More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0252 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  76.35 
 
 		 512 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  100 
 
 		 541 aa  1025    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  55.38 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  53.8 
 
 		 517 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  52.86 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  59.38 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  58.44 
 
 		 475 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  50.1 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  50.1 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  49.69 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  46.67 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  49.08 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  40.46 
 
 		 895 aa  351  2e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  34.85 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.62 
 
 		 605 aa  264  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.97 
 
 		 541 aa  239  8e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  34.78 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  37.1 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.97 
 
 		 495 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.39 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.16 
 
 		 557 aa  231  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  31.66 
 
 		 568 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  36.12 
 
 		 810 aa  226  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  37.08 
 
 		 510 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 568 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  32.14 
 
 		 466 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  32.14 
 
 		 466 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 		 551 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.02 
 
 		 593 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.53 
 
 		 574 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  30.8 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 551 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  35.25 
 
 		 568 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.82 
 
 		 564 aa  212  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  35.15 
 
 		 528 aa  211  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  35.56 
 
 		 764 aa  211  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  44.14 
 
 		 494 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 553 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 551 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.5 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  37.84 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  34.14 
 
 		 553 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.25 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.29 
 
 		 593 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  34.38 
 
 		 574 aa  204  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.98 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  32.31 
 
 		 553 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.97 
 
 		 534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  33.54 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.51 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.3 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 		 470 aa  200  7e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  32.43 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.66 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.11 
 
 		 568 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.27 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.72 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  28.96 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  25.93 
 
 		 568 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  34.49 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.87 
 
 		 550 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.01 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.98 
 
 		 582 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.47 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.64 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.64 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.74 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  26.95 
 
 		 569 aa  190  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  36.02 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.05 
 
 		 566 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.76 
 
 		 811 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.14 
 
 		 495 aa  190  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.6 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.86 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.74 
 
 		 566 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  30.35 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  33.87 
 
 		 498 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.49 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.18 
 
 		 566 aa  188  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  26.56 
 
 		 566 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.47 
 
 		 490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.52 
 
 		 628 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  27.61 
 
 		 489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  26.37 
 
 		 463 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 566 aa  183  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.21 
 
 		 576 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 		 770 aa  183  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.87 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.03 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.21 
 
 		 571 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  27.46 
 
 		 570 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.88 
 
 		 535 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  27.46 
 
 		 570 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  29.03 
 
 		 647 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>