More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4254 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  100 
 
 
456 aa  923    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  78.68 
 
 
464 aa  720    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  98.68 
 
 
456 aa  911    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  98.46 
 
 
456 aa  909    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  81.84 
 
 
448 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  81.66 
 
 
455 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  81.88 
 
 
455 aa  751    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  98.9 
 
 
456 aa  913    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  80.31 
 
 
454 aa  733    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  59.46 
 
 
454 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  57.58 
 
 
458 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  55.18 
 
 
451 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  52.37 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  41.37 
 
 
496 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  39.54 
 
 
456 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  37 
 
 
476 aa  222  8e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  35.97 
 
 
458 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  29.53 
 
 
509 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.51 
 
 
470 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  29.24 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  27.57 
 
 
537 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.08 
 
 
564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  28.33 
 
 
498 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.02 
 
 
450 aa  168  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.21 
 
 
531 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  27.89 
 
 
497 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 
770 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  29.09 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  29.14 
 
 
517 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 
551 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.13 
 
 
481 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.48 
 
 
489 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  30.96 
 
 
477 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  29.03 
 
 
482 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.69 
 
 
571 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.74 
 
 
539 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.05 
 
 
568 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.4 
 
 
810 aa  159  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  26.1 
 
 
568 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  27.31 
 
 
548 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.56 
 
 
510 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  26.16 
 
 
463 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.6 
 
 
473 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.88 
 
 
479 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.18 
 
 
491 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  26.95 
 
 
582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.33 
 
 
467 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  28.63 
 
 
541 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  31.19 
 
 
512 aa  153  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  24.67 
 
 
502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28 
 
 
551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  25.98 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  27.8 
 
 
495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  26.65 
 
 
484 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  28.08 
 
 
534 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  26.45 
 
 
574 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 
551 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  29.39 
 
 
526 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3343  ABC transporter related  29.05 
 
 
960 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  28.54 
 
 
512 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  25.32 
 
 
469 aa  151  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.27 
 
 
458 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.77 
 
 
495 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  26.53 
 
 
530 aa  150  5e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 
553 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.8 
 
 
553 aa  150  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  27.55 
 
 
471 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  30.19 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.89 
 
 
551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  27.81 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.89 
 
 
551 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 
551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  25.84 
 
 
483 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  28.51 
 
 
488 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  28.51 
 
 
488 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  27.8 
 
 
553 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  30.13 
 
 
541 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  25 
 
 
478 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  26.11 
 
 
497 aa  143  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.25 
 
 
550 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.49 
 
 
547 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  27.9 
 
 
492 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.56 
 
 
647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  26.88 
 
 
593 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.16 
 
 
558 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  27.53 
 
 
493 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.26 
 
 
1091 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  24.65 
 
 
501 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  25.38 
 
 
500 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.14 
 
 
573 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  25.49 
 
 
466 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  25.64 
 
 
558 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  25.49 
 
 
466 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  28.17 
 
 
524 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  26.89 
 
 
491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  28.49 
 
 
535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  23.18 
 
 
491 aa  137  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>