More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0661 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 467 aa  959    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  71.77 
 
 		 466 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  71.77 
 
 		 466 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  43.38 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  41.27 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  33.33 
 
 		 512 aa  230  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.9 
 
 		 764 aa  220  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.1 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.25 
 
 		 510 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.52 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  30.48 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  28.46 
 
 		 605 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.51 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  29.16 
 
 		 512 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.91 
 
 		 811 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  29.68 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  33.05 
 
 		 491 aa  204  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  30.82 
 
 		 539 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.5 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  30.88 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  30.72 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.01 
 
 		 568 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 		 579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.06 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 530 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.85 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  31.52 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 568 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  28.79 
 
 		 528 aa  196  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  28.21 
 
 		 557 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  27.78 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  30.26 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  28.71 
 
 		 553 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  30.26 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.45 
 
 		 1091 aa  193  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  29.39 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  32.14 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  28.27 
 
 		 647 aa  193  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 		 569 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.99 
 
 		 568 aa  193  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.58 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.29 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.25 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  28.85 
 
 		 574 aa  192  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 541 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  27.94 
 
 		 895 aa  190  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.24 
 
 		 493 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.71 
 
 		 573 aa  187  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.69 
 
 		 489 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  27.55 
 
 		 581 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  27.15 
 
 		 568 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  29.56 
 
 		 491 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  29.31 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  30.7 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  27.69 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  26.59 
 
 		 547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 		 474 aa  183  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.52 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  29.08 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  26.96 
 
 		 534 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.79 
 
 		 518 aa  182  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.37 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 		 551 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.38 
 
 		 562 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  28.95 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.83 
 
 		 558 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  26.96 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  27.8 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.25 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.24 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  27.08 
 
 		 481 aa  176  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0837  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  28.43 
 
 		 548 aa  176  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  30.11 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  25.56 
 
 		 593 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  26.48 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  26.69 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.68 
 
 		 491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.15 
 
 		 541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  27.75 
 
 		 464 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  28.91 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  28.28 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  26.97 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.21 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  26.65 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  27.17 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  27.79 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.02 
 
 		 566 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  28.32 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  26.2 
 
 		 479 aa  170  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  28.14 
 
 		 510 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  28.6 
 
 		 477 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  25.15 
 
 		 574 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  27.12 
 
 		 581 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  27.92 
 
 		 553 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>