More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
811 aa  1518    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50.52 
 
 
558 aa  361  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  41.26 
 
 
574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  40.46 
 
 
482 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.95 
 
 
495 aa  228  4e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.51 
 
 
764 aa  219  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
484 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.91 
 
 
467 aa  212  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  32.37 
 
 
483 aa  213  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  39.91 
 
 
488 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  39.91 
 
 
488 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  30.54 
 
 
466 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  30.54 
 
 
466 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  27.78 
 
 
895 aa  207  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.25 
 
 
605 aa  207  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  40.35 
 
 
488 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  38.16 
 
 
517 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.65 
 
 
568 aa  202  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  30.26 
 
 
568 aa  201  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  35.08 
 
 
528 aa  198  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  38.41 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  35.38 
 
 
491 aa  197  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  36.59 
 
 
512 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.93 
 
 
531 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.43 
 
 
497 aa  195  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  28.35 
 
 
518 aa  193  8e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  37.47 
 
 
539 aa  193  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  32.02 
 
 
534 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  35.21 
 
 
543 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.75 
 
 
557 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.22 
 
 
590 aa  185  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  27.25 
 
 
574 aa  183  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08030  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  53.45 
 
 
267 aa  183  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  32.11 
 
 
510 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
541 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  30.2 
 
 
541 aa  180  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  39.31 
 
 
475 aa  180  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  32.06 
 
 
512 aa  179  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.85 
 
 
571 aa  179  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.47 
 
 
548 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  27.94 
 
 
810 aa  178  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.98 
 
 
550 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.8 
 
 
568 aa  177  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 
474 aa  177  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.96 
 
 
530 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.12 
 
 
568 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  38.13 
 
 
475 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 
491 aa  173  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.66 
 
 
493 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.6 
 
 
501 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.33 
 
 
547 aa  172  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.02 
 
 
558 aa  171  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  27.57 
 
 
469 aa  171  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  30.7 
 
 
537 aa  171  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.74 
 
 
464 aa  171  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 
551 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.9 
 
 
479 aa  169  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  31.58 
 
 
449 aa  169  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.51 
 
 
497 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.62 
 
 
473 aa  167  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.47 
 
 
526 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  26.42 
 
 
489 aa  165  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.47 
 
 
486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.4 
 
 
495 aa  164  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  28.32 
 
 
490 aa  164  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27 
 
 
573 aa  164  8.000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 
470 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.29 
 
 
568 aa  163  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  33.67 
 
 
530 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
581 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  33.78 
 
 
491 aa  161  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.02 
 
 
568 aa  161  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 
551 aa  161  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 
551 aa  161  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  34.16 
 
 
535 aa  160  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 
551 aa  160  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.82 
 
 
481 aa  160  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.48 
 
 
551 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  33.48 
 
 
493 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.18 
 
 
457 aa  158  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  26.32 
 
 
579 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
553 aa  157  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  28.8 
 
 
553 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.61 
 
 
551 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 
553 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
540 aa  156  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  29.01 
 
 
581 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
474 aa  155  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
491 aa  154  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.43 
 
 
569 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.43 
 
 
569 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  30.31 
 
 
471 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  26.88 
 
 
576 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  31.07 
 
 
582 aa  154  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25.98 
 
 
593 aa  154  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  28.23 
 
 
553 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0091  cobalt transport protein  45.11 
 
 
258 aa  153  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0139648  normal  0.284452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.69 
 
 
553 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  24.71 
 
 
562 aa  152  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.82 
 
 
540 aa  150  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>