More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3443 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  100 
 
 		 475 aa  912    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  88.42 
 
 		 475 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  65.83 
 
 		 482 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  54.91 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  53.08 
 
 		 539 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  58.8 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  59.38 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  53.56 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  53.56 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  53.99 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  53.56 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  50.1 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  43.28 
 
 		 895 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  36.61 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 568 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.38 
 
 		 605 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  35.02 
 
 		 541 aa  251  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.49 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  31.98 
 
 		 574 aa  249  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  42.54 
 
 		 494 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  36.78 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  38.2 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.02 
 
 		 557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.05 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  36.12 
 
 		 571 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  37.28 
 
 		 764 aa  233  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  37.21 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  33.4 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.37 
 
 		 770 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.79 
 
 		 810 aa  223  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.71 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.54 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.22 
 
 		 497 aa  216  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  37.42 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 566 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  30.82 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.31 
 
 		 811 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  30.82 
 
 		 466 aa  213  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  35.23 
 
 		 528 aa  213  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  29.47 
 
 		 530 aa  212  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.4 
 
 		 558 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  34.56 
 
 		 537 aa  212  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.29 
 
 		 534 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 489 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  31.88 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.23 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 		 566 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  35.86 
 
 		 526 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  35.27 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.11 
 
 		 568 aa  206  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.15 
 
 		 566 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  27.39 
 
 		 568 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.65 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.63 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.4 
 
 		 582 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  32.2 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.77 
 
 		 566 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.38 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.88 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.64 
 
 		 573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 566 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28.48 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  29.92 
 
 		 470 aa  199  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.11 
 
 		 550 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.03 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.27 
 
 		 568 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.54 
 
 		 481 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 551 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  32.25 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26.63 
 
 		 568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.47 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.09 
 
 		 590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.12 
 
 		 566 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  35.91 
 
 		 495 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  27.52 
 
 		 570 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  31.28 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  27.52 
 
 		 570 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 551 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  34 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.77 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  31.15 
 
 		 585 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  31.55 
 
 		 581 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 551 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 474 aa  193  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  28.34 
 
 		 501 aa  193  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.54 
 
 		 656 aa  193  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.348562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.27 
 
 		 564 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>