More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3822 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3443  ABC transporter related  88.42 
 
 
475 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3822  ABC transporter related  100 
 
 
475 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  67.02 
 
 
482 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  55 
 
 
517 aa  445  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  52.98 
 
 
539 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  58.35 
 
 
512 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  54.32 
 
 
488 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  54.32 
 
 
488 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  58.64 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  54.32 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  51.24 
 
 
491 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  54.62 
 
 
492 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0414  cobalt transport protein  42.91 
 
 
895 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.624811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  35.98 
 
 
483 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
484 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  37.21 
 
 
548 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  37.5 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  38.03 
 
 
571 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31 
 
 
605 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  35.42 
 
 
541 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.2 
 
 
557 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  34.17 
 
 
568 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  38.16 
 
 
510 aa  240  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.7 
 
 
495 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  38.44 
 
 
764 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.46 
 
 
593 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  33.4 
 
 
512 aa  230  5e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4236  ABC transporter related  42.65 
 
 
494 aa  229  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
467 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 
579 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  30.08 
 
 
574 aa  223  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  28.71 
 
 
569 aa  223  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  36.57 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.02 
 
 
566 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  29.54 
 
 
593 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
770 aa  219  7.999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  31.65 
 
 
466 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  31.65 
 
 
466 aa  219  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
530 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  28.84 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.33 
 
 
497 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 
566 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 
566 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  29.25 
 
 
566 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.5 
 
 
566 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  28.85 
 
 
566 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  34.52 
 
 
810 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  28.65 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.76 
 
 
518 aa  213  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  32.15 
 
 
493 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 
566 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38 
 
 
558 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.69 
 
 
534 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.11 
 
 
573 aa  208  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  26.77 
 
 
568 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.51 
 
 
568 aa  207  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  37.37 
 
 
497 aa  206  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.91 
 
 
551 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  34.64 
 
 
464 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  33.95 
 
 
509 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.57 
 
 
566 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  33.54 
 
 
537 aa  204  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.89 
 
 
628 aa  203  7e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23320  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.55 
 
 
811 aa  203  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.69 
 
 
551 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  28.7 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  30.12 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  26 
 
 
568 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
470 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  27.59 
 
 
502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.31 
 
 
490 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  34.24 
 
 
456 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  34.49 
 
 
528 aa  199  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.26 
 
 
501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  27.36 
 
 
570 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
551 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  27.36 
 
 
570 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  30.17 
 
 
481 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  27.84 
 
 
558 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 
474 aa  196  7e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  33.02 
 
 
582 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.53 
 
 
478 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.38 
 
 
590 aa  196  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.89 
 
 
568 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  34.59 
 
 
574 aa  196  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.97 
 
 
551 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.7 
 
 
550 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  31.69 
 
 
553 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  35.54 
 
 
491 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.27 
 
 
564 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.17 
 
 
469 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  25.88 
 
 
562 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.97 
 
 
553 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.97 
 
 
551 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  29.46 
 
 
501 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  31.5 
 
 
553 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  34.63 
 
 
493 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  31.16 
 
 
458 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>