More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3675 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3675  ABC transporter-related protein  100 
 
 
454 aa  907    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0132  ABC transporter related  56.69 
 
 
458 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4087  ABC transporter related  55.1 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  54.18 
 
 
451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0090  ABC transporter related  52.37 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4449  ABC transporter related  52.14 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4254  ABC transporter related  52.37 
 
 
456 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4309  ABC transporter related  52.14 
 
 
456 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3872  ABC transporter related  51.68 
 
 
448 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4712  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.77 
 
 
464 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3866  ABC transporter related  52.98 
 
 
455 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3959  ABC transporter related  53.21 
 
 
455 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4070  ABC transporter related  51.57 
 
 
454 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0132  ABC transporter related  45.17 
 
 
496 aa  344  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2396  ABC-type transport system, putative ATPase component  39.59 
 
 
456 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1474  ABC transporter related  38.94 
 
 
476 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00070435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  34.4 
 
 
458 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.55 
 
 
553 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.18 
 
 
450 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  31 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  28.51 
 
 
537 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 
770 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  28.6 
 
 
481 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  27.84 
 
 
497 aa  173  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  26.57 
 
 
568 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 
566 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.42 
 
 
1091 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.53 
 
 
469 aa  171  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  32.34 
 
 
484 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  32 
 
 
491 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.24 
 
 
483 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.49 
 
 
502 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  30.44 
 
 
764 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 
566 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  29.5 
 
 
534 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 
566 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 
470 aa  167  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  28 
 
 
509 aa  167  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.87 
 
 
566 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 
566 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  28.51 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.85 
 
 
482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 
566 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  28.19 
 
 
493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  26.2 
 
 
502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.93 
 
 
467 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.01 
 
 
497 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  28.08 
 
 
571 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  27.34 
 
 
605 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  26.34 
 
 
478 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  28.45 
 
 
471 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  27.11 
 
 
474 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.91 
 
 
458 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.78 
 
 
566 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.64 
 
 
473 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  26.92 
 
 
566 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  26.01 
 
 
501 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.4 
 
 
540 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  30.54 
 
 
517 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  26.14 
 
 
647 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  32.27 
 
 
512 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  25.92 
 
 
566 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  28.35 
 
 
464 aa  156  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  25.64 
 
 
491 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  29.11 
 
 
510 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  30.28 
 
 
488 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  27.67 
 
 
568 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.27 
 
 
457 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  30.28 
 
 
488 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.73 
 
 
495 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  24.7 
 
 
568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  27.19 
 
 
490 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  26.77 
 
 
541 aa  154  4e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  27.14 
 
 
498 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  27.8 
 
 
481 aa  154  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.35 
 
 
501 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  29.42 
 
 
810 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  29.66 
 
 
490 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  26.35 
 
 
548 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  26.57 
 
 
531 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1158  ABC transporter related  28.03 
 
 
466 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  28.03 
 
 
466 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.57 
 
 
550 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  27.74 
 
 
510 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  29.06 
 
 
460 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  24.28 
 
 
491 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  26.36 
 
 
579 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.9 
 
 
568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  27.39 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  25.5 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  26.69 
 
 
530 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  29.44 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.96 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  25.69 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  28.79 
 
 
490 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0971  ABC transporter related  31.98 
 
 
492 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  26.14 
 
 
568 aa  146  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  25.65 
 
 
489 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  28.51 
 
 
491 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  27.4 
 
 
512 aa  144  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>