More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0613 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 627 aa  1278    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  44.67 
 
 		 641 aa  531  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  34.4 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  32.77 
 
 		 571 aa  350  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.9 
 
 		 593 aa  349  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  33.39 
 
 		 568 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 		 630 aa  333  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  32.7 
 
 		 576 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.84 
 
 		 557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.98 
 
 		 553 aa  323  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 571 aa  316  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  32.97 
 
 		 581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  31.05 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  32.7 
 
 		 569 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  32.7 
 
 		 569 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.11 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  31.38 
 
 		 574 aa  293  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.28 
 
 		 541 aa  292  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  33.1 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.44 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  28.91 
 
 		 585 aa  281  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  30.16 
 
 		 593 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  30.71 
 
 		 568 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 		 569 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.86 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  30.69 
 
 		 579 aa  270  8.999999999999999e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 566 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  29.86 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  30.48 
 
 		 587 aa  267  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 566 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.87 
 
 		 562 aa  266  8e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.52 
 
 		 566 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 		 566 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  34.1 
 
 		 490 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.72 
 
 		 534 aa  261  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  31.38 
 
 		 531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.03 
 
 		 590 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 		 566 aa  257  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  29.48 
 
 		 568 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.84 
 
 		 568 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  29.35 
 
 		 566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  31.01 
 
 		 543 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  28.7 
 
 		 566 aa  251  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.76 
 
 		 573 aa  249  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.11 
 
 		 526 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.76 
 
 		 279 aa  244  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  28.35 
 
 		 547 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.84 
 
 		 580 aa  241  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  29.68 
 
 		 501 aa  238  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  29.46 
 
 		 535 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  28.86 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  29.39 
 
 		 548 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 		 491 aa  231  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 551 aa  227  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.02 
 
 		 558 aa  227  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.65 
 
 		 547 aa  223  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  27.66 
 
 		 570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  27.66 
 
 		 570 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.92 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.74 
 
 		 280 aa  219  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 551 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 		 551 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  28.96 
 
 		 628 aa  217  5.9999999999999996e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 551 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 553 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.4 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 		 553 aa  210  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.6 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  26.81 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.6 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 		 770 aa  206  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.31 
 
 		 810 aa  204  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.67 
 
 		 540 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.42 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  28.92 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  40.78 
 
 		 510 aa  194  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.44 
 
 		 539 aa  194  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  29.41 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  30.07 
 
 		 570 aa  190  7e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  27.26 
 
 		 474 aa  190  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  35.66 
 
 		 282 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  26.76 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0090  ABC transporter related  27.29 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0101014  normal  0.484977 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  40.42 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  35.16 
 
 		 269 aa  181  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  26.35 
 
 		 552 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.8 
 
 		 641 aa  178  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.95 
 
 		 277 aa  178  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  39.81 
 
 		 284 aa  178  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  27.08 
 
 		 541 aa  174  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  28.45 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06420  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  25.75 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  39 
 
 		 281 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>