More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2438 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  63.01 
 
 		 555 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  60.74 
 
 		 588 aa  634    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  100 
 
 		 541 aa  1094    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  64.7 
 
 		 563 aa  691    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  83.03 
 
 		 542 aa  902    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  46.09 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  46.65 
 
 		 543 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.3 
 
 		 545 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  46.46 
 
 		 543 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.15 
 
 		 543 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 543 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  44.42 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  44.74 
 
 		 545 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.89 
 
 		 616 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.69 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.1 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 607 aa  432  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  43.92 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.42 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  44 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.05 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.79 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  45.79 
 
 		 539 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  42.64 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  43.7 
 
 		 554 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  46.21 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  46.24 
 
 		 544 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  45.54 
 
 		 533 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 536 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  43.62 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  43.95 
 
 		 527 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.6 
 
 		 539 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.4 
 
 		 611 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4520  ABC transporter related  46.92 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.94 
 
 		 542 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.39 
 
 		 615 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  38.75 
 
 		 564 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5135  ABC transporter related  45.98 
 
 		 571 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.47 
 
 		 612 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  42.75 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.98 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  45.3 
 
 		 543 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  43.71 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  44.15 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  44.13 
 
 		 611 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.68 
 
 		 617 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.87 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  43.49 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  44.91 
 
 		 544 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  42.88 
 
 		 525 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  45.24 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  42.36 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  45.83 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  41.46 
 
 		 624 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.15 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  44.25 
 
 		 556 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  44.21 
 
 		 537 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  41.91 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  41 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  39.96 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  42.18 
 
 		 572 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  44.05 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  42.13 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  45.05 
 
 		 540 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.01 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2636  ABC transporter related  43.71 
 
 		 547 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.723017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  43.48 
 
 		 533 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  43.82 
 
 		 569 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.02 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  45.05 
 
 		 540 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  42.35 
 
 		 546 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  44.66 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  43.51 
 
 		 603 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  42.52 
 
 		 599 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.33 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  44.68 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  43.15 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  41.24 
 
 		 623 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.93 
 
 		 619 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1351  ABC transporter related  44.02 
 
 		 544 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  45.22 
 
 		 542 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  42.5 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  42.69 
 
 		 538 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  44.91 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.12 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 547 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  42.45 
 
 		 576 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  44.27 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.95 
 
 		 536 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.02 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>