More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1131 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  100 
 
 		 570 aa  1152    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  32.46 
 
 		 628 aa  236  6e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.42 
 
 		 568 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  31.36 
 
 		 810 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.43 
 
 		 582 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  32.62 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 571 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.01 
 
 		 568 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  29.69 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.61 
 
 		 605 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.5 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  29.3 
 
 		 497 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  26.71 
 
 		 574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  30.57 
 
 		 501 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.84 
 
 		 541 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  31.17 
 
 		 553 aa  197  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 		 627 aa  194  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  31.08 
 
 		 497 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  31.67 
 
 		 585 aa  189  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.79 
 
 		 557 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 		 770 aa  183  8.000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  27.95 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  30.15 
 
 		 512 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  30.4 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  29.03 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.78 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  27.77 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  25.09 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.46 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  28.46 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  30.7 
 
 		 534 aa  173  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  30.59 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  31.89 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  29.28 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  27.93 
 
 		 501 aa  170  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 		 276 aa  170  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  24.72 
 
 		 568 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.15 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 551 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.57 
 
 		 551 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  29.26 
 
 		 537 aa  169  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  26.77 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 280 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.15 
 
 		 551 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  40.89 
 
 		 276 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 		 553 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  26.72 
 
 		 576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  28.11 
 
 		 531 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.89 
 
 		 280 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.85 
 
 		 300 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.16 
 
 		 277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  27.12 
 
 		 566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  31.31 
 
 		 543 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.44 
 
 		 280 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  28.24 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 		 280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 		 280 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.57 
 
 		 300 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  27.39 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.89 
 
 		 280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.89 
 
 		 280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 300 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.64 
 
 		 566 aa  164  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  29.41 
 
 		 490 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  25.95 
 
 		 566 aa  163  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  29.84 
 
 		 471 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  27.39 
 
 		 553 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  26.04 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  25.62 
 
 		 593 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.02 
 
 		 281 aa  163  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 280 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  26.69 
 
 		 566 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  37.12 
 
 		 281 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  30.43 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.15 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.62 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  25.61 
 
 		 553 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 		 566 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  29.39 
 
 		 469 aa  158  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  29.31 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.7 
 
 		 283 aa  156  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  26.64 
 
 		 573 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.3 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 277 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  26.05 
 
 		 566 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  36.84 
 
 		 273 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  36.84 
 
 		 273 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  28.39 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.3 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.57 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  33.68 
 
 		 273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  25.87 
 
 		 569 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  26.26 
 
 		 570 aa  154  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  26.26 
 
 		 570 aa  154  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>