More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1256 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  583  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  38.03 
 
 
582 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  38.76 
 
 
568 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  44.59 
 
 
574 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
571 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  42.92 
 
 
510 aa  204  9e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  43.91 
 
 
576 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  37.84 
 
 
605 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  40.97 
 
 
553 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  44.78 
 
 
569 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  44.78 
 
 
569 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  42.79 
 
 
571 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.15 
 
 
280 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  40.09 
 
 
531 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.46 
 
 
277 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.15 
 
 
280 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.53 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
300 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.54 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  39.65 
 
 
284 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  41.08 
 
 
574 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  40 
 
 
581 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  39.83 
 
 
497 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  49.77 
 
 
250 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  37.93 
 
 
535 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  37.6 
 
 
593 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  39.73 
 
 
547 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  41.13 
 
 
557 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
530 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.05 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.37 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  39.83 
 
 
581 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  37.6 
 
 
273 aa  172  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  38.12 
 
 
543 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
518 aa  170  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
630 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  34.19 
 
 
493 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  38.14 
 
 
530 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.54 
 
 
276 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.77 
 
 
281 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  39.37 
 
 
564 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.85 
 
 
280 aa  169  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
489 aa  168  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
277 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  39.24 
 
 
288 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.09 
 
 
279 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
581 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.06 
 
 
267 aa  166  4e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  38.18 
 
 
512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.08 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  36.32 
 
 
228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  40.95 
 
 
568 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.26 
 
 
526 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.68 
 
 
541 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 
566 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  38.38 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 
579 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  38.86 
 
 
568 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  36.16 
 
 
303 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.29 
 
 
280 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.85 
 
 
290 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  34.91 
 
 
641 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.83 
 
 
590 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 
248 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  36.5 
 
 
566 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  35.54 
 
 
500 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 
566 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 
566 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  34.8 
 
 
283 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  34.8 
 
 
283 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.63 
 
 
280 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 
279 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
406 aa  160  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  35.82 
 
 
566 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1924  ABC transporter related  31.75 
 
 
353 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405709 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  36.08 
 
 
593 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  37.72 
 
 
587 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  34.48 
 
 
537 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  37.27 
 
 
490 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.24 
 
 
580 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  40 
 
 
272 aa  158  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  41.28 
 
 
277 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  35.59 
 
 
540 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  40.61 
 
 
282 aa  158  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
474 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3475  ABC transporter related  34.62 
 
 
243 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
566 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  39.67 
 
 
286 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 
566 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 
566 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 
509 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
277 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 
566 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>