More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0848 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0848  ABC transporter related  100 
 
 
451 aa  880    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  40.76 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
530 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  36.03 
 
 
534 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  32.27 
 
 
531 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.66 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  35.18 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  32.85 
 
 
490 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
502 aa  206  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  33.33 
 
 
469 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  31.21 
 
 
489 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  34.5 
 
 
510 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 
470 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0945  ABC transporter related  34.49 
 
 
764 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  33.04 
 
 
493 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  30.8 
 
 
537 aa  194  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  30.78 
 
 
605 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  31.94 
 
 
497 aa  192  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.81 
 
 
541 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  30.29 
 
 
564 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.47 
 
 
495 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  32.2 
 
 
543 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.6 
 
 
473 aa  190  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  32.32 
 
 
449 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.39 
 
 
495 aa  189  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  30.36 
 
 
483 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  31.45 
 
 
516 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  31.86 
 
 
500 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.06 
 
 
550 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.29 
 
 
557 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 
551 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.1 
 
 
551 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.56 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  30.95 
 
 
471 aa  183  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  31.34 
 
 
548 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.69 
 
 
484 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  32.39 
 
 
501 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  30.96 
 
 
510 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  32.26 
 
 
482 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1029  ABC transporter related  33.41 
 
 
486 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3041  ABC transporter related  30.3 
 
 
553 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0282297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
551 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33 
 
 
540 aa  179  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.67 
 
 
647 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  29.1 
 
 
491 aa  179  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
551 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  31.78 
 
 
478 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  31.44 
 
 
493 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  31.2 
 
 
464 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0588  ATPase  32.79 
 
 
512 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0213611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 
551 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 
553 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 
551 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 
553 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  31.54 
 
 
535 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  31.25 
 
 
501 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 
553 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.93 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  29.26 
 
 
518 aa  172  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  26.92 
 
 
491 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  33.77 
 
 
528 aa  169  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  26.96 
 
 
463 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.12 
 
 
568 aa  167  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.44 
 
 
479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.35 
 
 
1091 aa  166  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  29.03 
 
 
566 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  32.57 
 
 
491 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  29.18 
 
 
498 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  25.63 
 
 
502 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  28.77 
 
 
574 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  28.36 
 
 
497 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  32.23 
 
 
482 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  28.04 
 
 
576 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  29.07 
 
 
581 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2114  ABC transporter-related protein  30.5 
 
 
549 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  30.3 
 
 
526 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.24 
 
 
457 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  30.52 
 
 
474 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  27.08 
 
 
474 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  28.76 
 
 
539 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  30.58 
 
 
541 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  29.21 
 
 
458 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  29.17 
 
 
514 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  41.86 
 
 
284 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0661  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 
467 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0988  ABC transporter related  31.58 
 
 
494 aa  157  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  30.15 
 
 
460 aa  156  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.1 
 
 
568 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  29.82 
 
 
491 aa  155  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  29.45 
 
 
517 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  28.27 
 
 
569 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  28.94 
 
 
490 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
581 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  28.74 
 
 
569 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.33 
 
 
568 aa  153  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  27.38 
 
 
593 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
630 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08020  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.98 
 
 
558 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.90589  normal  0.193312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  27.99 
 
 
569 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>