More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4172 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4172  ABC transporter related  100 
 
 		 490 aa  968    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00812866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4598  ABC transporter related  92.71 
 
 		 494 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0433816 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.07 
 
 		 1091 aa  352  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4772  ABC transporter related  40.38 
 
 		 500 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  39.07 
 
 		 493 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  41.26 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  37.79 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.51 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.1 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2305  ABC transporter related  39.52 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  36.08 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  40 
 
 		 514 aa  303  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  38.77 
 
 		 495 aa  300  5e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 491 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  32.42 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 502 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0324  ABC transporter related  37.33 
 
 		 493 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1484  ABC transporter related  36.29 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0315  ABC transporter related  38.97 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  37.73 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0311  ABC transporter related  41.2 
 
 		 490 aa  266  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00385444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  36.98 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  36.99 
 
 		 482 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3087  ABC transporter related  35.71 
 
 		 498 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  35.95 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  34.55 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  32.41 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  29.77 
 
 		 605 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  33.54 
 
 		 548 aa  220  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  32.8 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  30.58 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.77 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  30.86 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  30.24 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  31.35 
 
 		 481 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 540 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  29.69 
 
 		 568 aa  203  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  33.08 
 
 		 568 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  31.57 
 
 		 469 aa  200  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.08 
 
 		 483 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  28.71 
 
 		 568 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  34.32 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  27.47 
 
 		 566 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30.17 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  33.86 
 
 		 547 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 566 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.47 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.05 
 
 		 495 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 571 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.22 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.98 
 
 		 627 aa  194  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.13 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 		 566 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  32.26 
 
 		 582 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  30.23 
 
 		 557 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  31.07 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  34.76 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  32.07 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  27.15 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  28.23 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  31.92 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  31.92 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  29.12 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  31.98 
 
 		 526 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  31.37 
 
 		 501 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  30.08 
 
 		 574 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  32.53 
 
 		 488 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3008  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.4 
 
 		 566 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  27.09 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  28.94 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 		 551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  29.81 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  28.02 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  29.16 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  29.16 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1914  ABC transporter, ATP-binding protein  27.89 
 
 		 551 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.96 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0767  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.75 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.327658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  29.19 
 
 		 576 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  28.76 
 
 		 593 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0072  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.96 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  29.54 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  27.72 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 		 566 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1136  ABC transporter related  27.2 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.72541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>